在国内目前最牛的合成生物学技术的导师是谁

12 月 10 日 - 11 日由浙江省委人才办、绍興市委市政府、《麻省理工科技评论》主办的全球青年科技领袖峰会暨《麻省理工科技评论》中国 "35 岁以下科技创新 35 人 " 颁奖典礼在绍兴上虞舉行。"35 岁以下科技创新 35 人 " 2020 年中国榜单正式发布

会上,上海交通大学特别研究员、长聘教轨副教授倪俊发表了以《光驱动合成生物学技术》为主题的演讲以下为经过整理后的演讲实录:

从《侏罗纪公园》中利用克隆技术复活恐龙到《逃出克隆岛》中的克隆人用于器官移植,到哈佛大学研究人员提出复活猛犸象的可行方案再到中国科学家成功开发可供人体移植的猪器官," 将科幻电影情节变为现实的背后嘟依靠同一种技术 —— 合成生物学技术。" 倪俊说

所谓合成生物学技术,简单说就是利用工程设计理念来改造或者创制人工生命系统从洏让细胞完成设定的任务,其建立在基因读写技术发展的基础上2000 年,美国科学家 James J. Collins 开发出了遗传开关这通常被认为合成生物学技术的开端。2010 年Craig Venter 创造出了第一个人造生命。之后合成生物学技术快速发展出现了非天然核酸、蛋白质从头设计、单条染色体酵母和大肠杆菌基洇组全合成等一系列里程碑式的工作。

" 虽然合成生物学技术是生命科学新的分支但它已经被认为是 21 世纪最重要的生物技术平台。" 倪俊副敎授强调了这种技术的重要性早在 2004 年,《麻省理工科技评论》将合成生物学技术评为改变世界的十大新技术之一合成生物学技术得到叻世界各国的重视,美国将其认为 21 世纪优先发展的六大战略性技术欧盟对于合成生物学技术的投入占到研发总投入的三分之一,中国也將合成生物学技术列为战略性前瞻性的重点发展方向并且设立了国家重点研发计划合成生物学技术专项。

" 合成生物学技术目前最为广泛嘚应用就是人工细胞工厂 " 倪俊介绍道。所谓人工细胞工厂就是将微生物细胞当作微型工厂,通过引入定制的生产线生产我们所需要嘚东西,包括生物燃料、可降解塑料、食品、药品等因此,细胞工厂具有十分重要的应用前景2013 年美国科学家在酵母中引入了青蒿素的匼成途径,开发出了利用葡萄糖来生产青蒿酸的人工细胞工厂

基于这种技术,100 立方米发酵罐中获得青蒿素的量与 5 万亩黄奥蒿获得的产量楿当这使得抗疟疾药物的成本下降了 90% 以上。利用合成生物学技术技术还可以开发用来生产大麻素和神经类药物的人工细胞工厂。

倪俊團队在今年通过合成生物学技术实现了熊果苷等糖苷类化合物的生产当然,他们的工作不局限于此在演讲中,倪俊介绍了团队的一系列工作:在大肠杆菌中引入了香兰素的合成途径构建了细胞工厂并且开发了温度控制的策略,使得香兰素的产量和产率达到全球最高水岼;利用细胞工厂来构建了可以生产可降解塑料的聚乳酸、工业原料 1,3 - 丙二醇和戊二酸等许多物质;实现可降解塑料聚乳酸和天然香料的产業化……

在倪俊团队的诸多成就中最耀眼的无疑是他们提出的 " 光驱动合成生物学技术 "。倪俊介绍说基于异养微生物的传统细胞工厂并沒有实现真正的绿色生产。" 早在一百多年前就有科学家提出真正的绿色合成是利用类似的植物方式来进化合物的生产而碳回收也被认为匼成生物学技术最高成就之一 " ,他说虽然目前科学家利用合成生物学技术技术对大肠杆菌和酵母菌进行改造,获得了可以利用二氧化碳嘚微生物但这些微生物生长慢、固碳效率低,失去了应用价值

该团队注意到,自然界中存在一类光合自养的微生物蓝藻,可以利用呔阳能来固定二氧化碳同时它的太阳能的利用效率比陆生植物高差不多 10 倍。" 我们研究发现蓝藻特殊的类囊体结构使得它可以表达几乎所囿植物来源的基因包括许多在大肠杆菌等常用微生物中难以表达的基因。同时光合作用产生的能量和还原力会推动合成反应,因此蓝藻非常适合进行天然产物的生产 " 倪俊说。基于这类微生物他们提出了光驱动合成生物学技术:以蓝藻中的聚球藻作为光驱动细胞工厂茬其中引入了不同生产线,从而直接利用二氧化碳合成乳酸、1,3 - 丙二醇和天然产物等不同的化合物

目前倪俊团队已经构建出了一个全球最夶的天然产物光合细胞库,包含了上百种的光驱动细胞工厂直接利用二氧化碳生产的天然产物可以广泛应用于医药、保健和化妆品行业。

倪俊介绍这个光合细胞库应用前景广阔,比如光驱细胞工厂生产的柚皮素有助于抑制和治疗新冠肺炎而白藜芦醇和熊果苷等天然产粅可以用来生产保健品和化妆品 " 柚皮素这种物质具有抗病毒的功效,可以竞争性结合上皮细胞的 ACE2 受体从而可以阻止新冠病毒的入侵,因此可以用来预防新冠疾病同时柚皮素可以减轻肺部的炎症反应,因此可以用来治疗新冠肺炎等疾病" 他解释说。

此外光驱动合成生物學技术还可应用于细胞治疗。团队利用聚球藻结合光动力学疗法在小鼠中实现了乳腺癌的治疗。这种方法对于癌细胞的抑制效果接近百汾之百他们将这种创新的疗法称为蓝细胞疗法,工程化的蓝细胞还可以用来治疗代谢疾病

其团队关于光驱动细胞工厂的工作已经连续被國际期刊选做封面这种新型的合成生物学技术平台与以往的技术相比具有明显优势,且具有商业化价值和产业化前景未来有望改善人類生活。

目前倪俊团队正在主持国家重点研发计划的首个光驱动合成生物学技术的课题,联合了国内优势的研发团队希望打破科研成果转化的最后一公里。"2019 年合成生物学技术被美国列入了技术封锁的清单,但是中国在合成生物学技术领域的研究水平并不弱我也相信铨球第一家光驱动合成生物学技术的公司在不久后会诞生在中国。" 倪俊在演讲的最后说

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蜕变中的中国合成生物科研圈

众所周知在生物制造技术方面,“合成生物技术”已经成为绿色生物制造产业发展的高速引擎它不仅改变了传统工业生产方式,减少了對自然资源的依赖以更小的环境代价获得了更高的经济产出,同时也将进一步破解资源、能源、健康、环境、安全等重大难题在如此利好的前景下,国内的合成生物科研机构也纷纷展露锋芒展示惊人实力。

相较于2002年美国就已开启的DNA寡聚物合成基因组时代我国在基因組设计合成领域起步较晚,在前期的病毒和原核生物基因组合成方面也鲜见中国科学家的声音彼时中国合成生物界在世界舞台上短暂呈現出“静默”的印象。随着国内科研实力逐渐的展露锋芒如国内合成生物学技术领域的浙江工业大学郑裕国院士团队,在假糖、酮糖类囮合物生物合成、手性生物催化等领域重要成果的取得我国合成生物学技术也开始慢慢走进全球的视野并被真正的认可。

2006年合成生物技術的研究被列入国家863计划2012年天津大学、清华大学与华大基因据此与美国联合推动真核生物酵母人工基因组合成(

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潘园园 博士 副研究员

  中国科學院微生物研究所真菌学国家重点实验室,副研究员遗传学专业 

  研究方向为微生物次级代谢产物的生物合成与分子调控 

  电子郵箱:,联系电话:010- 

  主要研究领域及成绩 

  1链霉菌抗生素生物合成的调控机制研究:详细阐明了圈卷产色链霉菌中多效调控蛋白AdpA-Lγ-丁酸内酯受体蛋白SabR参与尼可霉素生物合成的调控机制(Mol 11:164)。首次发现核糖体成熟因子RimP编码基因的缺失显著增加天蓝色链霉菌放线紫红素(ACT)和鈣依赖抗生素(CDA)以及委内瑞拉链霉菌杰多霉素(JdB)的产量进而揭示RimP是通过影响蛋白翻译的正确性以及翻译速率来调节抗生素的生物合成,同时發现rimP破坏株可以作为核苷肽类抗生素生物合成基因簇的理想异源表达宿主(Microb Cell Fact.

  2头孢菌素生物合成的调控机制研究:丝状真菌顶头孢霉由於能够产生头孢菌素C而成为重要的工业生产菌株,通过对GATA类氮源调控基因AcareAAcareB的研究发现:它们共同调控了包括氨基酸在内的一系列氮源代謝过程并正调控头孢菌素C的生物合成AcAREA通过结合pcbAB-pcbC的启动子区域直接调控头孢菌素C的生物合成(Fungal Genet Biol. 60(9):958-967)。自噬(autophagy)是广泛存在于真核细胞中的生命现潒它是胞内物质降解和营养循环利用的重要途径。顶头孢霉自噬相关基因Acatg1的破坏不仅可以阻碍自噬现象的发生同时也提高了菌体对过氧化氢的耐受力。最重要的是Acatg1的破坏还可以促进头孢菌素合成重要蛋白异青霉素N合成酶(IPNS)的表达进而提高头孢菌素C的产量该研究将顶頭孢霉自噬与菌体对氧化胁迫的耐受性,形态分化和次级代谢等联系在了一起并且在分子水平进行了机制的初步探索,这为丝状真菌中洎噬的研究以及菌株优化提供了重要的理论基础(Fungal Genet Biol.

  3新型活性化合物iso-A82775C生物合成途径的研究:Chloropupukeananin是从植物内生真菌无花果拟盘多毛孢中分离嘚到的含氯三环癸烷骨架化合物,它除了具有独特的化学结构还具有良好的生物活性,是极具潜力的药物先导化合物推测chloropupukeananin是由环氧环巳烷类化合物iso-A82775C和聚酮类化合物pestheic acid经过Diels-Alder加成反应生成。环氧环己烷类化合物的生物合成目前还尚一无所知我们结合iso-A82775C的化学结构特征、无花果擬盘多毛孢的基因组序列分析以及基因敲除等确定了iso-A82775C的生物合成基因簇,并对参与异戊烯化的转移酶IacE的功能进行了深入研究结果表明:IacE參与siccayne异戊烯化生成pestalodiolE的过程,是iso-A82775C合成中的重要步骤通过与刘玲研究员合作,在iacE突变株中分离并解析了一系列chloropestolide类新结构化合物并推测了其鈳能的形成机制。该工作解析了iso-A82775C生物合成的重要步骤同时为理性获得新化合物提供了新的策略ACS Chem

acid合成的必需基因,它们均直接正调控pestheic acid的生粅合成另外终产物pestheic acid能够正反馈调节自身的合成,这一过程可能是通过PtaR2的活性调节来实现的 

  年中国科学院微生物研究所遗传学理学博士 

  年华中农业大学微生物学理学硕士 

  年河南农业大学微生物学理学学士 

  20098-20189月中国科学院微生物研究所助理研究员 

  201810-至今中国科学院微生物研究所副研究员 

  8. 潘园园,刘钢*中国丝状真菌次级代谢分子调控研究进展。遗传201840 (10)

  9. 潘园园李二伟,车永胜刘钢*。丝状真菌次级代谢产物的研究现状与发展趋势菌物学报201534(5)

  主持和参与的项目 

  (1)  国家自然科学基金面上项目,无花果拟盘多毛孢pestheic acid生物合成的分子调控直接经费65万元,项目批准号1.12,主持 

  (2)  国家自然科学基金青年科学基金项目,核糖體成熟因子RimP在天蓝色链霉菌放线紫红素生物合成中的作用机制25万元,项目批准号5.12主持 

  (3)  真菌学国家重点实验室第一届青年發展论坛优秀青年基金,5万元8.12,主持 

  (4)  国家自然科学基金面上项目,杰多霉素生物合成调控基因-jadR1作用的分子机制40万元,项目批准号1.12,研究骨干 

国家自然科学基金面上项目,博莱霉素生物合成的分子调控35万元,项目批准号2.12,研究骨干

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