二代测序cell数是指?

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【网综合报道】Illumina作为测序行业的龙头企业,所占市场份额达70%。最初由四位博士于1998年共同创建,总部位于美国加利福尼亚圣地亚哥,主要销售微阵列芯片,于2000年在纳斯达克挂牌上市。2006年收购Solexa公司,获得新一代技术,从而成为目前市场上的主流测序技术公司。

步骤一.建库,在DNA片段两端加上序列已知的通用接头构建文库,文库加载到测序芯片Flowcell

步骤二. 簇生成。文库两端的已知序列与Flowcell基底上的Oligo序列互补,每条文库片段都经过桥式PCR扩增形成一个簇

步骤三. 簇扩增及测序。与步骤二同时进行。即在碱基延伸过程中,每个循环反应只能延伸一个正确互补的碱基,根据四种不同的荧光信号确认碱基种类,保证最终的核酸序列质量,经过多个循环后,完整读取核酸序列。

每个flowcell有8个泳道,一个泳道称为一个Lane,每条Lane上有两列,每列有多个有小格子,叫一个tile。

测序仪器不同,可以放置的FlowCell个数和Lane的条数也有所区别。

下面一张图展示建库以及簇生成。

X连接起来,当然仪器价格会高,但如果达到通量,单G数据成本也会大大降低。由于HiSeq X Ten价格太高,通量太大,2015年又推出了HiSeq X five,HiSeq X Ten的缩小版,由五台HiSeq X组成,同时推出的还有HiSeq 和NextSeq 550.

测序时间快,可以用小或者外显子的测序。测序成本相对HiSeq要高

NextSeq 500 于2014年初登陆市场,测序通量介于MiSeq与HiSeq之间,是目前最为灵活的测序平台,可以进行高中低通量的需求,例如外显子、转录组、人的全基因组测序等。2015年,新推出了NextSeq 550系统,整合了高通量测序和芯片扫描功能,测序模块与NextSeq 500完全相同,适用于学和生殖。

参考整理来自Illumina官方网站和网络资源

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淋巴瘤二代测序技术研究进展

sequencing,NGS)又称为高通量测序,能够在一次测试中对大量基因(数百至数千)进行测序,具有高通量、灵敏度高等优势.近年来,NGS在肿瘤基因突变检测、靶向治疗以及预后疗效判断等方面发挥重要作用,也逐渐被应用于探索淋巴造血肿瘤的分子发病机制以及指导临床诊疗,为多种淋巴瘤(经典型霍奇金淋巴瘤、Burkitt淋巴瘤、弥漫大B细胞淋巴瘤、NK/T细胞淋巴瘤等)的靶点检测、预后判断、发病机制研究、未知基因的检测等提供了准确有效的线索,在淋巴造血肿瘤的分子机制研究以及临床个性化精准治疗方面发挥重要作用.

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