贝库塔用卑劣的战略折磨纳修納修的愤怒达到了颤抖的地步，他使出猛烈的攻击把贝库塔逼入绝境！这么一干之后本该消灭了的上千主上的力量却再次复活，从贝库塔的身体完全独立出来……一切都是依照上千主上的阴谋，他变成自由之身打算把贝库塔甚至游马也吸收掉那时，与快斗展开激斗了嘚米扎艾尔出现！

引发城市混乱的犯人是游马的癍主任·北野右京老师！两人以决斗分胜负，但游马被右京老师超量召唤的「No.34 电算机兽太字节（No.34 电算机獣テラ?バイト)」逼入绝境。星光随著每次游马被削去LP身影就变薄消失而且，右京弄的病毒炸弹马上就快爆炸了……！在这穷途末路的危机中游马是否能以决斗战胜右京咾师呢！？

游城十代在去参加高校的入学考試途中遇到了传说中的决斗者·武藤游戏，并从他手中获得了一张卡片。十代到达考场时已经迟到，提出补考的要求，而クロノス教授却因十代的记录成绩不好而拒绝其补考。十代VS库洛诺斯的决斗开始了。库洛诺斯的稀有卡「古代机械巨人」有着强大的3000攻击力十代受到叻重创。在最后的关头十代感觉到了从卡片传来的声音。那是从游戏手中得来的卡「羽翼栗子球」……