如何给C原子态的标记法标记?

化学思维结构决定性质  结构决定性质”是学习化学的重要思维方法,金属原子的结构决定金属活动性强弱.同一周期从左到右随原子  “结构决定性质”是学习化学的重要思维方法,金属原子的结构决定金属活动性强弱.同一周期从左到右随原子半径的减小,金属活动性减弱;同一族从上到下随原子半径的增大,金属活动性增强.如图是三种重要金属在元素周期表中的位置关系,试推断它们的.金属...  根据“金属原子的结构决定金属活动性强弱.同一周期从左到右随原子半径的减小,金属活动性减弱;同一族从上到下随原子半径的增大,金属活动性增强”.根据图中三种重要金属在元素周期表中的位置关系,可推断它们的金属活动性顺序为:C>A>B.因为A的最外层只有一个电子,所以在化学反应中容易失去电子,其金属性很强,能置换水中的氢,同时生成相应的碱,根据质量守恒定律,则可写出A与水反应的化学方程式为 2A+2H 2 O=2AOH+H 2 ↑.  故答案为:  C>A>B. 失去,2A+2H 2 O=2AOH+H 2 ↑  怎样建立“化学思维”  一、对比法 。主要化学反应是氧化还原反应,氧化反应和还原反应是一对相反的过程,我们学习时要把氧化反应和还原反应进行对比学习,记住典型的氧化还原反应方程式,掌握这两类反应的区别和联系,然后,再以此为基础,把“氧化——还原反应”就可以作为一个线索,从“氧化——还原反应”入手。  把课本的知识“串”起来:看到某个化学反应,马上就能想出相关的化学现象;看到某个化学方程式,马上就能想到这个化学方程式中对应的每个化学物质的性质,想到这些化学物质又能跟其他哪些物质发生反应,等等  二、结构决定性质。 根据结构决定性质的规律,我们可以从物质的结构可以推出其性质:由最外层电子数为7,可推知单质的氧化性较强,得电子后形成离子还原性较弱,而其他含有卤素(正价)的化合物大多数都有较强的氧化性等等。  因此学习化学时牢牢掌握化学物质的结构:最外层电子数,核外电子层数,原子半径等,可以帮助我们了解这些物质的性质。  而且,理清各种基本微粒之间的数量关系,熟悉氧化还原反应中电子转移的方向和数目,弱酸根离子水解、酸式盐的电离所应起的离子数目的变化等,可以**提高我们做题的效率。化学思维结构决定性质扩展阅读化学思维结构决定性质(扩展1)——思维方式决定人的一生句子(思维的语录)1.忌妒别人,不会给自己增加任何的好处;忌妒别人,也不可能减少别人的成就。2.时时提醒自己,不断改变自己,调整自己,以积极的心态去面对所有的一切,这样,才能在愉快地生活中不断提升自己,才能抓往机会,展示自己,发展自己。3.学着改变自己,因为自己还不完善,还有很多缺点需要去改,还有很多坏习惯去改。4.不外笑也有良多种,有的笑欢愉,有的笑委曲,有的笑馅媚,伟哥的效果,有的笑酸苦。5.任何的抱怨都是无济于事的,只会让自己的状况更糟糕,尝试着去改变自己,你会觉得体内被注入了新鲜的血液,还会有更多新的发现!6.太多的人养成了专挑别人毛病的习惯,用自己之长比他人之短,这种精神上的麻醉只能使自己更加颓废,只后退不前进。如果我们能够认真学习他人的长处,我们就是在进步,在改变自己。7.诚实的面对你内心的矛盾和污点,不要欺骗你自己。8.年轻时我们放弃,以为那只是一段感情,后来才知道,那其实是一生。9.不要刻意去曲解别人的善意,你应当往好的地方想。10.你不要一直不满人家,你应该一直检讨自己才对。不满人家,是苦了你自己。11.改变!改变!自己为什么要去改变?因为不满现状,因为有一颗雄心,有一个跟现在环境不能吻合的梦想!12.喜欢一个人,是不会有痛苦的。爱一个人,也许有绵长的痛苦,但他给我的快乐,也是世上最大的快乐。13.变自己还需要一个持之以恒的心态,并不是我今天改变了一点点,明天就又倒回去了,这个月我进步了一点点,下个月又开始懒惰了,如果是这样的话,你永远也改变不了自己,永远都在原地踏步,停止不前。14.改变自己就是改变自己的缺点,改变自己就改变自己落后的一面!面对未来的人生我们要有努力改变自己的勇气,还要有努力改变自己的决心,具备了这些,我们的人生就永远是一个有活力的人生!15.当你知道迷惑时,并不可怜,当你不知道迷惑时,才是最可怜的。16.不要束缚,不要缠绕,不要占有,不要渴望从对方的身上挖掘到意义,那是注定要落空的东西。17.认识自己,降伏自己,改变自己,才能改变别人。18.伟人之所以伟大,是因为他与别人共处逆境时,别人失去了信心,他却下决心实现自己的目标。19.不要浪费你的生命,在你一定会后悔的地方上。20.夸奖我们,赞叹我们的,这都不是名师。会讲我们,指示我们的,这才是良师,有了他们我们才会进步。21.改变自己并不意味着就失去了自我,放弃了做人的原则,把自己的优点也改变了。只有自己改掉自己不好的,才能留下更好的,只有知道了什么是不变的,才能找到自己哪些是需要改变的。22.不要刻意去猜测他人的想法,如果你没有智慧与经验的正确判断,通常都会有错误的。23.一语道尽爱情的残酷。情到深处人孤。痛苦使人成熟,坚强的人会感悟爱的真谛,而脆弱的人徒生怨恨。24.人生本来就是多姿多彩的,生活的面貌时时刻刻都会不同,大自然里尚且有变色龙的存在。这一切都在告诉我们学着改变自己的重要,这也告诉我们只有改变自己,才会更好地适应这个绚烂多彩的社会。25.常以为别人在注意你,或希望别人注意你的人,会生活的比较烦恼。26.人不可能完美,却可以去追求完美,去接近完美。让我们对生活微笑以待,让我们学着改变自己,无愧生命的伟大,生活的美好!27.很多的时候,当我们周围的世界、我们周围的环境不尽如人意的时候,很多人常常采用的是对抗或者消极懈怠的态度来对待,结果只能导致自己更加的失落与消退。28.人啊,最大的敌人总是自己,战胜了自己的不足,你就是彻彻底底的胜利者!29.若想改变人生,首先要改变我们自己。而改变我们自己,首先要正确的认识自己,敢于否定自己。30.不要在你的智慧中夹杂着傲慢;不要使你的谦虚心缺乏智慧。31.当你快乐时,你要想,这快乐不是永恒的。当你痛苦时,你要想,这痛苦也不是永恒的。32.也许每个人都会在经历过某些变化后,学着慢慢的改变,慢慢的成长,然后放下所有的骄傲与固执。33.一个常常看别人缺点的人,自己本身就不够好,因为他没有时间检讨他自己。34.根本不必回头去看咒骂你的人是谁?如果有一条疯狗咬你一口,难道你也要趴下去反咬他一口吗?35.很多的时候,当我们周围的世界我们周围的环境不尽如人意的时候,很多人常常采用的是对抗或者消极懈怠的态度来对待,结果只能导致自己更加的失落与消退。36.人不可能完美,却可以去追求完美,去接近完美。让我们对生活微笑以待,让我们学着改变自己,无愧生命的伟大,生活的美好!化学思维结构决定性质(扩展2)——化学性质的定义与化学变化的区别化学性质的定义与化学变化的区别  化学性质是物质在化学变化中表现出来的性质。如所属物质类别的化学通性:酸性、碱性、氧化性、还原性、热稳定性及一些其它特性。下面是小编给大家整理的化学性质的定义与化学变化的区别,希望能帮到大家!  化学性质的定义  物质在发生化学变化时才表现出来的性质叫做化学性质。如:可燃性、稳定性、酸性、碱性、氧化性、还原性、助燃性、腐蚀性、毒性、脱水性等。它牵涉到物质分子(或晶体)化学组成的改变。  化学性质与化学变化是任何物质所固有的特性,如氧气这一物质,具有助燃性为其化学性质;同时氧气能与氢气发生化学反应产生水,为其化学性质。任何物质就是通过其千差万别的化学性质与化学变化,才区别于其它物质;化学性质是物质的相对静止性,化学变化是物质的相对运动性。  化学性质与化学变化的.区别  化学性质:物质在化学变化中表现出来的性质叫做化学性质。  化学变化:物质发生变化时生成新物质,这种变化叫做化学变化,又叫做化学反应。  应该注意化学变化和化学性质的区别,变化是一个过程,性质属于能力的范畴;如蜡烛燃烧是是石蜡和氧气反应,生成水和二氧化碳,化学变化;这一变化证明蜡烛能燃烧,则是石蜡的化学性质。物质的化学性质由它的结构决定,而物质的结构又可以通过它的化学性质反映出来。物质的用途由它的性质决定。化学变化和物理性质两个概念的区别。如灯泡中的钨丝通电时发光、发热是物理变化,通过这一变化表现出了金属钨具有能够导电、熔点高、不易熔化的物理性质。人们掌握了物质的物理性质就便于对它们进行识别和应用。如可根据铝和铜具有不同颜色和密度而将它们加以识别。又可根据它们都有优良的导电性而把它们做成导线用来传输电流。  物质的化学性质与化学变化,变化时都生成了其它的物质,这种变化叫做化学变化,又叫化学反应。  化学性质与化学变化是两个不同的概念,性质是物质的属性,是变化的内因,性质决定变化;而变化是性质的具体表现,在化学变化中才能显出化学性质来。例如,酒精具有可燃性,所以点燃酒精,就能发生酒精燃烧的化学变化;而酒精的可燃性(化学性质)是通过无数次酒精燃烧现象得出的结论。  化学性质的判断方法  如可燃性、稳定性、不稳定性、热稳定性、酸性、碱性、氧化性、助燃性、还原性、络合性、毒性、腐蚀性、金属性、非金属性跟某些物质起反应呈现的现象等。用使物质发生化学反应的方法可以得知物质的化学性质。  例如,碳在空气中燃烧生成二氧化碳;盐酸与氢氧化钠反应生成氯化钠和水;加热KClO3到熔化,可以使带火星的木条复燃,表明KClO3受热达较高温度时,能够放出O2。因此KClO3具有受热分解产生O2的化学性质。 化学性质的特点是测得物质的性质后,原物质消失了。如人们可以利用燃烧的方法测物质是否有可燃性,可以利用加热看其是否分解的方法,测得物质的稳定性。物质在化学反应中表现出的氧化性、还原性、各类物质的通性等,都属于化学性质。化学思维结构决定性质(扩展3)——口味决定性格口味决定性格  早在两千多年前,医学家就发现营养与人的性格有关。在古老的希腊,凯波克拉蒂斯首次创造了气质学说,将人的性格分为多血症、神经症、黏液质、胆汁质4大类。他认为人的性格依本身各种体质含量的多少而定。下面是小编收集整理的口味决定性格,希望大家喜欢。  口味决定性格 篇1  喜欢吃清淡食物  性格特点:注重交际,善于接近别人,个性随和,但**性不强,不愿意单枪匹马地行事。  营养原因:喜食清淡的人往往新陈代谢相对较慢,因此不属于思维特别活跃的类型,处事多能泰然处 之,但缺乏统帅才能和决断力。  生理提示:日常生活中清淡的饮食值得提倡。但过少糖分与盐分的摄入可能引起食欲不振和消化不良。  喜欢吃酸  性格特点:有事业心,但性格孤僻,不善交际,遇事爱钻牛角尖,没有知心朋友  营养原因:酸性食物多含有较高的非金属元素,如硫、氯、磷等。正常人体的血液应为弱碱性,血液如呈偏酸性,不利于人的正常思维活动。过多的酸性食物的摄入形成的"酸性体质"极有可能是性格孤僻甚至"孤独症"的直接成因。  生理提示:爱吃酸味,怀孕常是第一个联想,但肝、胆功能不佳,也会偏爱酸味。  喜欢吃咸味食品  性格特点:待人接物稳重,有礼貌,做事有计划,埋头苦干,但比较轻视人与人之间的感情,有点虚伪。  营养原因:盐类富含金属元素,如钠、钾、钙、镁等阳离子,金属离子是神经传导的重要递质,也可以说是理性思维活动的'重要环节,因此喜欢高盐食物的人更具工作的计划性和条理性,但往往感性思维不够,因而相对比较冷漠。  生理提示:口味重,爱吃咸的人,可能是体内缺碘。吃太多盐,易高血压、肾脏病。要摄取碘质,可改由海苔、海鲜中取得,日常生活宜采低盐分饮食为佳。  口味决定性格 篇2  爱吃大米 经常自我陶醉,孤芳自赏;对人对事处理得体,比较通融,但互助精神差。有点自得其乐,且不爱帮助别人。  爱吃面食 能说会道,对事物容易渲染,意志不很坚定,容易丧失自信。  爱吃煮、炖食 性格温和,和谁都谈得来,常富于幻想,但不愿表现自己。  喜欢吃烤制品 比较专心致志,上进心强,性情急躁,欠温和,爱出主意但又缺乏当机立断的气魄。  喜欢吃油炸食品 勇于冒险,有干一番事业的愿望,但受到挫折,即灰心丧气。  喜欢吃生冷食品 对大自然有浓郁的兴趣,比较坚强,但不愿表现自己,不太好接近。  喜欢吃酱菜 较稳重,善于埋头苦干,做事有计划,一般不太看重人与人之间的感情。相反不喜欢吃酱菜的人多富于亲情,没有架子,容易接近,有钻研精神,且能吃苦。化学思维结构决定性质(扩展4)——有机化合物的结构特点是什么有机化合物的结构特点是什么  有机物是生命产生的物质基础,所有的生命体都含有机化合物。下面是小编给大家整理的有机化合物的结构特点,希望能帮到大家!  有机化合物的结构特点  有机化合物:种类繁多、数目庞大(已知有3000多万种、且还在以每年数百万种的速度增加)。  但组成元素少有C、H、O、N、P、S、X(卤素:F、Cl、Br、I)等。  1、有机化合物中碳原子的成键特点  碳原子最外层有4个电子,不易失去或获得电子而形成阳离子或阴离子。碳原子通过共价键与氢、氧、氮、硫、磷等多种非金属形成共价化合物。  由于碳原子成键的特点,每个碳原子不仅能与氢原子或其他原子形成4个共价键,而且碳原子之间也能以共价键相结合。碳原子间不仅可以形成稳定的单键,还可以形成稳定的双键或三键。多个碳原子可以相互结合成长短不一的碳链,碳链也可以带有支链,还可以结合成碳环,碳链和碳环也可以相互结合。因此,含有原子种类相同,每种原子数目也相同的分子,其原子可能有多种不同的结合方式,形成具有不同结构的分子。  2、有机化合物的同分异构现象  化合物具有相同的分子式,但结构不同,因此产生了性质上的差异,这种现象叫同分异构现象。具有同分异构现象的化合物互为同分异构体。在有机化合物中,当碳原子数目增加时,同分异构体的数目也就越多。同分异构体现象在有机物中十分普遍,这也是有机化合物在自然界中数目非常庞大的一个原因。  有机化合物的特点  除含碳元素外,绝大多数有机化合物分子中含有氢元素,有些还含氧、氮、卤素、硫和磷等元素。已知的有机化合物近8000万种。早期,有机化合物系指由动植物有机体内取得的物质。自1828年维勒人工合成尿素后,有机物和无机物之间的界线随之消失,但由于历史和习惯的原因,“有机”这个名词仍沿用。有机化合物对人类具有重要意义,地球上所有的生命形式,主要是由有机物组成的。有机物对人类的生命、生活、生产有极重要的意义。地球上所有的生命体中都含有大量有机物。  和无机物相比,有机物数目众多,可达几千万种。而无机物目却只发现数十万种,因为有机化合物的碳原子的结合能力非常强,可以互相结合成碳链或碳环。碳原子数量可以是1、2个,也可以是几千、几万个,许多有机高分子化合物(聚合物)甚至可以有几十万个碳原子。此外,有机化合物中同分异构现象非常普遍,这也是有机化合物数目繁多的原因之一。  有机化合物一般密度小于2,而无机化合物正好相反。在溶解部分,有机化合物一般可溶于汽油,难溶于水。无机化合物则易溶于水。  有机化合物的定义  有机物是含碳化合物(一氧化碳、二氧化碳、碳酸、碳酸盐、碳酸氢盐、金属碳化物、氰化物、硫氰化物等氧化物除外)或碳氢化合物及其衍生物的总称。有机物是生命产生的物质基础。无机化合物通常指不含碳元素的化合物,但少数含碳元素的化合物,如二氧化碳、碳酸、一氧化碳、碳酸盐等不具有有机物的性质,因此这类物质也属于无机物。  有机化合物除含碳元素外,还可能含有氢、氧、氮、氯、磷和硫等元素。  总之,有机化合物都是含碳化合物,但是含碳化合物不一定是有机化合物。  最简单的.有机化合物是甲烷(CH4),在自然界的分布很广,是天然气,沼气,煤矿坑道气等的主要成分,俗称瓦斯,也是含碳量最小(含氢量最大)的烃。  它可用来作为燃料及制造氢气(H2)、炭黑(C)、一氧化碳(CO)、乙炔(C2H2)、氢氰酸(HCN)及甲醛(HCHO)等物质的原料。  拓展阅读:系统命名法  系统命名法是有机化合物命名的重点,必须熟练掌握各类化合物的命名原则。其中烃类的命名是基础,几何异构体、光学异构体和多官能团化合物的命名是难点,应引起重视。要牢记命名中所遵循的“次序规则”。  1、烷烃的命名  烷烃的命名是所有开链烃及其衍生物命名的基础。命名的步骤及原则:  (1)选主链选择最长的碳链为主链,有几条相同的碳链时,应选择含取代基多的碳链为主链。  (2)定编号给主链编号时,从离取代基最近的一端开始。若有几种可能的情况,应使各取代基都有尽可能小的编号或取代基位次数之和最小。  (3)书写名称用*数字表示取代基的位次,先写出取代基的位次及名称,再写烷烃的名称;有多个取代基时,简单的在前,复杂的在后,相同的取代基合并写出,用汉字数字表示相同取代基的个数;*数字与汉字之间用半字线隔开。记忆口诀为:选主链,称某烷。编碳位,定支链。取代基:写在前,注位置,短线连。不同基:简到繁,相同基,合并算。  2、几何异构体的命名  烯烃几何异构体的命名包括顺、反和Z、E两种方法。简单的化合物可以用顺反表示,也可以用Z、E表示。用顺反表示时,相同的原子或基团在双键碳原子同侧的为顺式,反之为反式。  如果双键碳原子上所连四个基团都不相同时,不能用顺反表示,只能用Z、E表示。按照“次序规则”比较两对基团的优先顺序,两个较优基团在双键碳原子同侧的为Z型,反之为E型。必须注意,顺、反和Z、E是两种不同的表示方法,不存在必然的内在联系。有的化合物可以用顺反表示,也可以用Z、E表示,顺式的不一定是Z型,反式的不一定是E型。例如:脂环化合物也存在顺反异构体,两个取代基在环*面的同侧为顺式,反之为反式。  3、光学异构体的命名  光学异构体的构型有两种表示方法D、L和R、S,D 、L标记法以甘油醛为标准,有一定的局限性,有些化合物很难确定它与甘油醛结构的对应关系,因此,更多的是应用R、S标记法,它是根据手性碳原子所连四个不同原子或基团在空间的排列顺序标记的。光学异构体一般用投影式表示,要掌握费歇尔投影式的投影原则及构型的判断方法。  根据投影式判断构型,首先要明确,在投影式中,横线所连基团向前,竖线所连基团向后;再根据“次序规则”排列手性碳原子所连四个基团的优先顺序,将最小基团氢原子作为以碳原子为中心的正四面体顶端,其余三个基团为正四面体底部三角形的角顶,从四面体底部向顶端方向看三个基团,从大到小,顺时针为R,逆时针为S。  4、双官能团和多官能团化合物的命名  双官能团和多官能团化合物的命名关键是确定母体。常见的有以下几种情况:  ① 当卤素和硝基与其它官能团并存时,把卤素和硝基作为取代基,其它官能团为母体。  ② 当双键与羟基、羰基、羧基并存时,不以烯烃为母体,而是以醇、醛、酮、羧酸为母体。  ③ 当羟基与醛基、羰基并存时,以醛、酮为母体。  ④ 当羰基与羧基并存时,以羧酸为母体。  ⑤ 当双键与三键并存时,应选择既含有双键又含有三键的最长碳链为主链,编号时给双键或三键以尽可能低的数字,如果双键与三键的位次数相同,则应给双键以最低编号。化学思维结构决定性质(扩展5)——最有狼性思维的星座女最有狼性思维的星座女  最有狼性思维的星座女,星座的世界是斑斓又神秘的,宇宙的浪漫我们得以从星座中窥见一二,这个星座一般比较神秘浪漫,星座的解释和*的十二生肖也是有相似之处的,一篇文章看懂最有狼性思维的星座女,各种星座。  第四名、天蝎座女生  天蝎座女生神秘且具有魅惑能力,她们表面上看起来冷冰冰的,但实际上内心非常火热,典型的外冷内热。不仅如此,天蝎女的洞察力与感知能力都很强,善于观察生活当中的各种细微之事,没有任何东西能够轻易逃脱她们的法眼,这与敏锐的老狼十分相似。  而在职场当中,天蝎女力争上游,努力上进,对于自身有着非常高的职业期望,肯努力,也吃得了苦,在*日里从不得意忘形,而是善于隐藏自己的'欲望和能力,养精蓄锐,以求有朝一日能够厚积薄发,天蝎女也算是能力十分了得的女子。  第三名、摩羯座女生  摩羯座女生同样也是非常有狼性的,有着土象该有的坚韧性,执着无畏,一往无前。而在生活当中,大多数摩羯女都是一副默默无闻,安安静静的姿态,她们从不浮夸和炫耀,为人低调内敛,懂得****,而不是耀武扬威,这一点非常符合狼的气质。  除此之外,摩羯女也从来不会是一个乐于安逸的女人,她们看似*庸,但大智若愚,内心**细腻,对很多事情都能有清醒理智的看法,对于自己的人生发展也有着非常清晰的规划,并且还会积极地向着自己的目标一步步努力前进,摩羯女从不主动退缩,是一个能够狠得义无反顾的女人。  第二名、射手座女生  射手座女生看似自在随风、无欲无求,其实也属于非常有狼性的女生。在在她们性格中的表现会比较极端,射手女对于自己的欲望通常会有两种表现,要么不争,顺其自然;要么努力争取,不择**。前者暂且不说,这多半是属于一些爱玩又比较不思进取之人。  后者则往往不容小觑,射手女能力十足,做事情非常果断,对于自己的选择会义无反顾地坚持,从来都不畏惧外界异样的眼光。不仅如此,在追求目标的时候,往往无所不用其极,甚至不择**,努力争取自己的想要的东西,射手女内心强大且高傲,经常还会令人产生一种无形的**感,是一位十分可怖的女人。  第一名、狮子座女生  狮子座女生大多都是充满血性和霸气的一类人。狮子女在生活当中情奔放,敢爱敢恨,拿得起放得下,往往也是野心勃勃、目标远大,拥有鸿鹄之志,由于天性使然,大多数的狮子女非常坚强,遇事不服输,是最为强势的女人。  狮子女勇往无前,****,对于自己想要的东西,多半会选择努力奋斗与争取,于她们而言,其人生当中根本就没有所谓的“求”这一个字,从来不会求人,也不屑于求人,但凡自己能做到的,必定不会假借与他人之手,而若是狮***能做到的,也会选择****,霸道强悍的同时也非常有底线、有原则。  处女女  处女座是十二星座中最有追求的,她们喜欢高品质的生活方式,喜欢追求完美;更喜欢高人一等的优越感。处女座的女生都有点高冷,对自己充满自信;尤其在事业上,处女女表现出的强势,不同于*常女子;她们喜欢做一个强者,也同样享受强者带来的所有事物。处女女是这新时代的女强人,通过自己不断的努力、不断积极进取;在职场上闯出一片天地;这样的处女女可谓是最了不起的女性**了。  射手女  射手女灵活、聪慧,向往**;她们和过去的女性不一样的地方就是敢于追求、****,她们喜欢一切新颖的事物,接纳新事物;对生活充满了热情。她们的为人处世很积极、乐观,喜欢帮助弱小的人,更热衷于公益事业,喜欢给身边的人带去正能量;她们不畏惧世人的眼光,做自己想做的事情。还有谁能像射手女一样活得如此洒脱,活得如此快乐。因为她们高傲的做自己,践行自己的思想与理念;所做的事,无不令人敬佩;了不起的射手女!  狮子女  狮子座的人天生自带王者的气概,就算是女子也是如此;职场上雷厉风行的行事风格,用自己的专业与理性制服一切不可能的事儿,狮子女的强势犹如王者;生活中也亦是如此,生而俱来的气质,在爱情里也是比较有**欲,把自己最强势的一面来抵挡内心的脆弱。这也许就是狮子女最了不起的地方,刚毅的外表下也有一颗柔弱的女人心。化学思维结构决定性质(扩展6)——历史的思维:常用历史学习的思维方法历史的思维:常用历史学习的思维方法  “历史”是一个总称,涉及到过去的事件以及记忆,发现,收集,**,介绍,以及关于这些事件的信息解读。写历史的学者称为历史学家。下面是小编整理的历史的思维:常用历史学习的思维方法,欢迎大家借鉴与参考,希望对大家有所帮助。  1、抽象与概括  抽象与概括也是重要的思维过程。历史概念的形成,也要经过抽象与概括的过程。抽象就是在思考过程中从同类事物中的各种属性和特征中,抽出其中最重要的最基本的和最本质的东西,而撇开一切表面的复杂的次要的内容。概括就是把抽取出来的个别事物的本质属性,归纳成同类事物的普遍的东西。所以概括出来的属性不只是个别事物的属性,而是该类事物的共有的本质的属性。  例如,关于帝国**概念的抽象与概括。为了使学生形成对帝国**国家的概念,首先要对英、法、德、美、俄各资本**国家经济发展的状况、垄断**的出现、对外扩张的**和每个帝国**的特征等,分别进行介绍。在介绍的基础上抽象出这些帝国**共有的主要特征,那就是:生产的高度集中和垄断;金融资本发展并出现金融寡头;资本的输出;资本**国际垄断同盟形成;最大的资本**列强把世界**分割完毕。这里抽出的帝国**的五大基本特征,不但撇开了每个帝国**的次要的表面的内容,而且还撇开了每个帝国**单独具有的特点,例如撇开了**帝国**的托拉斯的特点。所以说,这里抽象出的帝国**的五大特征是最重要的基本的本质特征,是一切帝国**国家共有的东西。为了更加准确牢固地掌握“帝国**”的概念,还必须把这些基本特征联合成一个整体,给帝国**下一个完整简明的定义:“帝国**是发展到垄断**和资本的**已经确立,资本输出具有特别重大的意义,国际托拉斯开始分割世界,最大的资本**国家已把世界全部**分割完毕这一阶段的资本**。”所以这里所概括出来的有关帝国**的一般特征和属性,不是英、法、美等各帝国**单独具有的,而是一切帝国**毫无例外的本质属性。这就是抽象和概括的方法,形成“帝国**”这个概念的具体步骤。  抽象的方法就是撇开非本质属性而抽取事物的本质属性。抽象和概括是对立和**的不可分割的过程。抽象为概括作准备,而概括则是抽象的继续和完成。历史教学中,运用抽象与概括的方法使学生形成历史概念的事例是极为常见的。  2、联系和比较  历史是严格时空观念的整体,它不断地运动、发展和变化着,有它纵的发展规律;同时,历史事件之间又是相互联系、相互影响和相互制约的,有它横的普遍联系。因此,学习历史就要掌握联系法。一是纵向联系,抓住一历史特征,把相关的历史事实连点成线,观其发生和发展的过程,形成专一、系统的历史知识。例如,*历代**经济**、历代生产工具、历代农民****和历代科技文化,等等。二是横向联系,把某一历史横断面中发生的相关事件,归类联系,找出带特点性的内容,从而巩固和深化知识。例如,将英美法三国资产阶级**的原因、进程、措施及意义诸方面进行联系和比较,就可掌握它们各自的特点。掌握联系法,就是要从纵向联系上落实知识的完整性,从横向联系上落实知识的层次性。  历史的发展不仅具有继承性、联系性,而且历史现象或事件之间还有相似性。因此,学习历史还要掌握比较法。一是归类比较。把各时期同类型的人物、事件、**串成一线,按专题分类别作比较。二是分析比较。包括正反两方面的比较、表面现象相同而实质不同的比较、性质相同而特点不同的比较、时代不同而有密切联系的比较。三是程度比较。例如,评价农民**的意义,课本有时用“**”、“摧毁”,有时却用“瓦解”、“动摇”,有时则用“削弱”。这些均应综合比较,求同析异。  从课文学习来看,比较的主要内容有:  (1)比较不同内涵的历史概念,揭示事物本质特征。在历史学习中,学生常常会混淆一些相似或相关联的历史概念,如***和农奴**、旧****和新******、资产阶级和民族资产阶级及资产阶级**和资产阶级****等,即使同一概念术语,如“人民”这个概念,在不同历史阶段,其内涵和外延往往也是不同的。对此,就要有意识地用不同例证加以比较和分析,弄清其本质和特征。  (2)把发生在不同历史阶段的性质相同又紧密联系的历史事件综合比较,找出其内在联系或发展变化的规律。例如把世界著名的工人运动,如里昂的工人**、巴黎工人六月**、巴黎公社、俄国十月**等加以归类比较,从中得出无产阶级觉悟不断提高,**不断深入,**水*逐步提高的规律。  (3)把性质相同或相似的历史事件作比较,归纳其特点。例如可以从背景、**者、纲领性文件、**过程、主力军**措施(特别是国家**和土地**)、**范围及结果等方面比较英法资产阶级**,从而认识到英国资产阶级**的曲折性、反复性及不彻底性和法国资产阶级**的人民性及它是资产阶级**时代最大最彻底的**这一特点。  (4)把某些表象上相同、性质不同的历史事件作比较,认清其实质。例如**大化改新和明治维新,它们都是在社会矛盾激化的情况下进行的向先进国家学习的自上而下的**,其结果都促进了**社会发展,但其性质却根本不同。认识性质的不同要分析“到位”,不能只达到记忆的效果。  (5)比较正反两方面的情况,从而归纳分析出成败原因。如将**明治维新成功和*戊戍变法失败的原因进行分析比较。  (6)比较同一阶级对不同**的态度,从而认识该阶级在历史上的作用。例如比较法国资产阶级对18世纪晚期资产阶级**的态度,从而认识资产阶级的历史地位和作用。  (7)比较中外历史。例如把郑和下西洋和新航路开辟进行比较,***后的发展情况同其它国家比较。  3、归类贯通  *时学史,按章逐节,掌握的是各种类型“点”的`知识,缺乏一定的全面性和系统性,致使理解不深,记忆困难,前学后忘。尤其在记忆两种相似或同类知识时,容易互相干扰,造成史实混淆。历史总复习时,面对大量的中外纵横交错的各类知识点的同时,有必要从宏观上掌握“线”和“面”的知识,使之形成“纵向几条线横向几大片;点面相结合,井然有条理”的知识网络,以利牢固掌握,驾驭运用。  心理学告诉我们,知识越系统化,理解记忆知识的能力就越强。利用同类事物便于联系的规律性特点,像数学中“合并同类项”那样,将教材中同类型、同性质或具有某一共同特征的中外历史知识,按照纵向或横向两个方面,连类并举,归纳梳理,“积点成线”,“连点成面”,形成“条”“块”分明的知识网络。这种以类相从,逐类贯通的知识,提纲掣领、条理清晰,揭示了事物发展的全过程,为深入理解、融会贯通、综合运用历史知识创造了条件。  (1)分清知识类型。历史知识一般分为**、经济、军事和科技文化等大类。以战争类为例,就有内战,扩张战争,争霸战争,民族**战争,民族**战争,自卫反击战及以少胜多、以弱胜强等类型;每场战争又包括了一些重要战役。只有分清类别,才能有的放矢地集中教材各章节中的相关知识,按时间顺序,逐一排列,使知识专一系统。这样,就能简化记忆程序,减少记忆坡度,提高学史效率。  (2)列表归类。列表归类是一种有效的方法。一种是纵向类知识表,如*历史纪年表、两次****简表;一种是横向类知识表,如英美法三国资产阶级**简表。这类知识表,采用形式、内容、次序的对比和类比的方法,把纷繁的历史事件和人物按一定的方向、顺序加以有机排列,制成表格,把分散在各章节中的相关知识条理化系统化列表归类的过程,犹如“梳头发”、“编辫子”,理清了头绪,突出了重点。列表项目,可视内容而异。  (3)叙述归类。叙述归类,通常适用于重要历史人物或重大历史问题。然而,运用归类在填空形式进行知识整理,则是叙述归类贯通知识的好形式之一。充分运用这种形式,不仅可以系统掌握所学知识,而且可以适应选择、填空、列举和排列等客观性题型的变化和要求,以不变应多变,起到学用一致的作用。尤其在标准化考试逐步推行,客观性题型大幅度增加的今天,其重要性更是显而易见。如*古代的赋税**屡有变比,分散在*古代史的几个章节中,靠单一记忆,容易疏漏混淆。经过串联整理,*古代赋税**及其演变过程,就清楚无误了。这种贯通知识的过程,也是巩固知识的过程,有利于突出重点,进行分析、比较和灵活运用。  (4)纵向串连。每个国家的发展史,都是世界历史发展的一个组成部分。教材按照人类社会的发展阶段,分段叙述了各国的历史,显得错综复杂。因此,按照国别贯穿历史知识,这对掌握每个国家的历史发展进程和重大历史事件,是大有裨益的。  (5)横向联络。在纵向串联掌握知识完整性的同时,有必要横向归纳掌握知识的层次。例4,19世纪末20世纪初,亚、非、拉美掀起了民族****:在亚洲,朝鲜的甲午农民战争和义兵运动,*的义和团运动和辛亥**,1905—1908年的印度民族**运动,伊朗、土耳其的资产阶级**。在非洲,阿尔及利亚的抗法**,埃及、苏丹的抗英战争,埃塞俄比亚人民抗意战争的伟大胜利。在拉丁美洲,墨西哥资产阶级**。这样,由于帝国**的大量资本输出、疯狂侵略和掠夺,激起了亚、非、拉美人民的坚决**,谱写了反帝反封建**的光辉篇章。  4、分析与综合  分析与综合是基本的思维过程,通过分析与综合,帮助学生形成历史概念。所谓分析,就是在思考的过程中把对象的整体分解为不同的部分,把事物的个别特征或属性分析出来。例如对“唐末农民战争”的分析,一般可分为这样几个部分:一是历史背景:唐朝均田制的破坏和土地兼并,安史之乱和藩镇割据,苛捐杂税和严重的旱灾。二是**的过程:王仙芝率众**;黄巢采取流动作战策略,攻占长安,建立大齐*。三是**的结果:奋战十年,遭到了失败,但瓦解了唐*,摧垮了魏晋以来的士族**,推动了社会的发展。把整个唐末农民**分解成这样几个部分,目的是为了认识这次**的原因、过程和结果,认识历史经验教训。  所谓综合,就是在思考过程中把认识对象的各个部分联合成一个整体,或把事物的各个特征、属性联系起来。只有分析而无综合,一个完整的历史对象在头脑中就会变成一种被肢解的状态,就不能获得关于认识对象的全面认识。仍以“唐末农民**”为例,要形成有关“唐末农民**”的科学概念,就要把分解的各结构部分加以综合:以黄巢为首的唐末农民**是*农民战争史上的一次伟大创举,它奋战十年,瓦解了唐*,推动了历史的发展。这样,分析的结果经过综合,在思维中就表现为概念。化学思维结构决定性质(扩展7)——预测蛋白质二级结构的快速方法预测蛋白质二级结构的快速方法  蛋白质二级结构预测方法是首先预测蛋白质的结构类型,下面是小编搜集整理的预测蛋白质二级结构的快速方法的内容,欢迎阅读参考。  1、研究背景及意义  蛋白质二级结构的预测是生物、数学与计算机交叉领域的课题,进行二级结构预测对于理解蛋白质结构与功能的关系,以及分子设计、生物制药等领域都有重要的现实。随着人类基因组计划的顺利实施,已知氨基酸序列的蛋白质数量成级数增长,目前试验**主要依靠X射线晶体衍射与核磁共振方法测定蛋白质二级结构,但测定周期较长,导致已测定二级结构的蛋白质数量与已知氨基酸序列的蛋白质数量差距越来越大,要求有一种快速简洁而适用性强的预测蛋白质二级结构的方法。而蛋白质的氨基酸排列顺序决定了它的空间结构,空间结构体现了蛋白质的生理功能,那么就可以从已知序列和结构的蛋白质出发,挖掘出其中的关系,就可以预测出其他已知序列的蛋白质的二级结构。如果准确率达到要求则对于了解生命现象的本质,解释疾病的发生机制,诊断、治疗疾病、设计新药、通过不同生物蛋白质结构研究生物进化、利用其他生物为人类服务等都有着非常重要的意义。综上,蛋白质结构的预测对于蛋白质的研究与应用领域具有很好的推动作用。  2、预测方法  二级结构预测一直都是学者喜欢研究的问题,研究时间长,目前预测二级结构预测的方法已经有很多,但是在准确率上都达不到所希望的要求,因此无数的人依然为此努力着。  (1)经验参数法。  经验参数法是一种基于单个氨基酸残基统计的经验预测方法。通过统计分析,获得的每个残基出现于特定二级结构构象的倾向性因子,进而利用这些倾向性因子预测蛋白质的二级结构。1970年由PeterY.Chou和GeraldD.Fasman提出Chou-Fasman方法是预测蛋白质二级结构的经验方法。这种方法基于每个氨基酸在α螺旋的相对频率,测试表,和通过X射线晶体学已知的蛋白质结构。从这些频率、概率参数,可知道每个氨基酸在各个二级结构类型的外观,而这些参数是用来预测某一氨基酸序列将形成一个螺旋,一个测试链,或一个又一个蛋白质的概率的。该方法在确定正确的二级结构准确性约50-60%,这明显比现代机器学习技术的准确性要低。  (2)GOR方法。  GOR方法是一种基于信息论和贝叶斯统计学的方法,是统计算法中理论基础最好的。GOR将蛋白质序列当作一连串的信息值来处理,基本原理是将蛋白质的一级结构和二级结构看成一个转化过程的两个相互联系的信息;GOR方法不仅考虑被预测位置本身氨基酸残基种类的影响,而且考虑相邻残基种类对该位置构象的影响。为了避免大量的实验数据,GOR将信息函数分为多项式和的形式。  (3)Lim方法-立体化学方法。  氨基酸的理化性质对二级结构影响较大,在进行结构预测时考虑氨基酸残基的物理化学性质。立体化学是从三维空间揭示分子的结构和性能。手性分子是立体化学中极其重要的部分之一。同分异构在有机化学中是极为普遍的现象。立体异构是指分子中的原子或基团在空间的排列不同步产生的异构现象。利用不同氨基酸家族的性质差异来进行二级预测。  (4)同源分析法。  同源分析法是将待预测的片段与数据库中已知二级结构的片段进行相似性比较,利用打分矩阵计算出相似性得分,根据相似性得分以及数据库中的构象态,构建出待预测片段的二级结构。该方法对数据库中同源序列的存在非常**,若数据库中有相似性大于30%的序列,则预测准确率可**上升。  (5)BP神经网络算法。  在生物信息学研究中,应用得最多的神经网络模型是多层前馈网络模型,这种模型使用最广泛的算法是BP算法,即反向传播算法。它属于有导师学习的算法。这种模型也叫BP神经网络。网络通过对已有氨基酸编码建立序列到结构,结构到结构的两层网络进行学习,预测的准确性上有极大的提高。  3、方法分析  蛋白质二级结构预测方法是首先预测蛋白质的结构类型,然后再预测二级结构。通过对各个方法的比较可以得到:  (1)与传统经典方法相比,利用特征信息提取方法可涵盖序列统计特征、氨基酸物理化学特征、氨基酸片段位置分布三方面的信息,此方法可以较为全面地反映出蛋白质序列中有**性的特征信息。  (2)通过采用有效的特征挑选算法以及分类算法,既有效减少了信息的冗余,又提高了结构类预测模型的准确率。  综上,本研究从信息学角度出发,系统地解决蛋白质信息提取、多特征信息组合及结构类预测等信息处理问题,有助于蛋白质的结构及功能研究,同时也对蛋白质序列分析、机器学习领域的发展有很大的帮助。  (3)目前普遍使用的,考虑多条序列的方法,运用长程信息和蛋白质序列的进化信息,准确度有了比较大的提高。  4、结语  由上述的各种方法可以看出有很多方面的因素会影响蛋白质二级结构的预测,如目前已知的蛋白质太少,大部分处于未知阶段。  针对目前的蛋白质数据库资源的贫乏性特点,如何选择适当的预测方法和评估准则将决定蛋白质预测的准确率的高低。因此在选择时应该多种方法综合利用,不仅包括各种预测方法的综合,而且也包括结构实验结果、序列对比结果、蛋白质结构分类预测结果等信息的综合。多个程序同时预测,综合评判得到一致结果;序列比对与二级结构预测;双重预测。对模型进行反复优化,以提高预测的准确率和实际价值。  参考文献:  [1]闫*凡,张长水.人工神经网络语模拟退火计算[M].**:清华大学出版社,2000.  [2]沈世镒,神经网络系统理论及其应用[M].科学出版社,2000.  [3]唐媛李,春花,蛋白质二级结构的研究进展[J].现代生物医学进展,2013.  [4]杨存荣,孙之荣,模式识别方法预测蛋白质二级结构的研究[N].清华大学学报(自然科学版),第32卷,第1期,1992.  [5]王勇献,蛋白质二级结构预测的模型与方法研究[D].工学博士学位论文.  摘要:  基于空间约束的蛋白质结构预测方法是一种以已知结构为模板预测蛋白质结构的方法。其中,它提取了模板结构中的同源约束,结合力场中的立体化学约束,作为优化初始结构的条件,从而对初始结构进行调整,最终得到模型。本文主要综述了基于空间约束的蛋白质结构预测方法的原理,所涉及的空间约束,以及应用与软件。  关键词:  蛋白质结构预测;空间约束;同源模建  近些年来,基因组计划为我们提供了大量的蛋白质序列。我们只有理解了新蛋白质的功能,基因组计划才能真正实现它的意义。为了描述,理解和操控蛋白质的功能,就必须首先确定蛋白质的结构。然而,实验方法测定蛋白质结构代价很高且费时费力。由于实验方法确定蛋白质结构存在缺陷和不足,蛋白质结构确定的速度跟不上序列测定的速度,且差距在不断扩大。因此,完全依靠实验方法确定蛋白质结构已经不能满足现实的需求[1]。上世纪70年代,人们发现蛋白质三级结构是由其一级序列决定的,这也就意味着可以从蛋白质序列中获取蛋白质三级结构的信息。这一发现为计算机预测蛋白质结构提供了理论依据。经过了40余年的发展,计算机预测蛋白质结构的技术日趋成熟。其中,同源模建方法是一种以已知结构的蛋白质为模板预测目标蛋白质结构的方法。因为一级序列的相似性越高,两个蛋白质的`三级结构的相似性也越高。  同源模建方法是从模板序列和目标序列的比对开始的。合适的模板是同源模建得到好模型的基础。同源模建方法一般分为四个步骤:序列比对,模建结构,结构优化和结构评估[2]。  不同的同源模建方法的区别主要体现在第二步模建目标模型上。最传统的也是使用最广泛的模建方法是刚体装配法。此方法使用从已知结构中获得的刚体结构信息组装模型。基于这类同源模建方法的程序有COMPOSER。另一类方法就是片段匹配法。片段匹配法,又称坐标重建法,是基于发现大部分的蛋白质结构片段都是聚类到大约100个结构分组中。搜索并确定其余原子坐标的方法一般是搜索所有已知结构或者是基于能量函数的构象搜索。第三类同源模建方法是基于空間约束的同源模建方法。由于这种基于约束的模建方法可以使用关于目标序列的各种不同的信息,所以它是所有同源模建方法中最有前途的[3]。  1.基于空间约束的同源模建方法  基于空间约束的同源模建方法通过目标序列与模板序列的比对结果,得到目标序列结构上的许多约束或者限制。这些约束通常是通过假设目标序列和模板序列上的相对应的距离和角度是相似的得到的。空间约束除了这些同源约束还包括:立体化学约束。然后使用空间约束来优化模型的初始结构,使模型结构对这些空间约束的违背最小,从而得到最终的模型结构。模型的初始结构可以通过距离几何法或真实空间优化法来实现。然后空间约束和力场数据项都被整合到一个客观函数中去。最后,在笛卡尔坐标系中当客观函数的函数值最小时,得到模型的最终结构。基于空间约束的同源模建方法的优势之一是不同来源的约束和限制都很容易被添加到同源约束中去。同样,基于空间约束的同源模建方法的进一步的发展也是因为各种约束的加入,使得这种方法更加完善。当然,好的优化算法的选择也是改善这种方法的途径[4]。  1.1距离约束和距离几何法 最早的基于约束的蛋白质结构预测方法使用的约束一般都是距离约束,这些距离约束数据都是来自实验检测结果。PerJ Kraulis等人[5]提出了一种使用核磁共振数据确定蛋白质结构的方法,其中使用了蛋白质原子间的距离数据。Hiroshi Wako等人[6]应用距离约束法预测了牛胰蛋白酶抑制剂的三级结构。其中,他们考虑了氨基酸残基的亲疏水性,并且设定了螺旋与延伸结构和片层结构中的*均距离,合并了特定的半胱氨酸残基之间的二硫键的位置信息和五个特殊的残基对之间的确切距离信息。他们定义了一个客观函数,通过使用这一系列的距离约束数据,使客观函数最小化,从而确定目标蛋白质的最终结构。其中使用的距离约束数据都是通过对14个已知结构的蛋白质的距离数据的统计分析总结得到的。  距离约束数据方便使用分子内部坐标表示,分子内部坐标仅仅体现保守结构特征的相对位置,而忽略分子的位置和方向。其他模建研究表明使用距离坐标系统处理分子内部结构约束问题非常有用。因为欧几里得变换群中的每一个几何特征不变量都可以用距离来表示,所以距离坐标系统可以替代笛卡尔坐标。笛卡尔坐标可以通过程序重新恢复。Havel TF等人[7]结合使用核磁共振数据和距离几何法确定了胰蛋白酶抑制剂的结构,并证明了使用该方法计算蛋白质的完整结构是可行的。使用距离几何法解决同源模建问题,就是一个确定具有同源性的蛋白质中结构相似的原子的分子内距离的过程。Andras Aszodi等人[8]设计了一种基于距离几何法的同源模建方法,这种方法能在相对较短的时间内得到大量的低分辨率的片段,它是通过一系列的嵌入折叠整个简化的模型,也就是把结构投射到逐渐减小的维度的欧几里德空间中去。  1.2空间约束和真实空间优化法 基于空間约束的同源模建方法逐渐被人们认可,越来越多的其他类型的约束信息被添加到方法中来。这也使得这种方法越来越完善。Andrej Sali等人[9]开发了一种整合了多种空间约束的同源模建方法,其中包含的空间约束有Cα原子之间的距离约束,NO原子之间的距离约束,立体化学约束,主链二面角约束以及侧链二面角约束。这种方法的基本步骤是,首先,根据模板序列与目标序列的比对结果,从模板结构中提取相对应的同源约束,这些约束的展现形式都是概率密度函数,也就是每一个同源约束就产生一个概率密度函数;然后通过多目标函数法和共轭梯度算法来对得到的概率密度函数进行优化,得到最优解,即模型结构信息。  Cα原子之间的距离约束,也就是约束目标蛋白质中两个不同氨基酸残基的Cα原子之间的距离的概率密度函数。这个概率密度函数也就是一个高斯分布,其中高斯分布的*均值是模板结构中对应残基的Cα原子之间的距离,标准差是通过已知结构中Cα原子之间的距离;两个比对序列的部分同源性;已知结构中这段距离两端的残基的部分溶剂亲和性;距离两端的残基离空位的*均距离四个参数根据相应的计算公式得到的。立体化学约束是根据标准力场数据对目标蛋白质中的原子位置的约束。其中涉及了原子距离,角度,二面角,所以立体化学约束函数也有很多种,比如高斯函数,余弦函数等等。构建这些约束函数所需要的参数也是来源于力场数据。蛋白质中主链骨架原子之间的键形成的二面角称为主链二面角。根据组成二面角的原子类别的不同,可以将主链二面角分为三类。其中,由于二面角位置的特殊性,第三类主链二面角的变化比较单一。正是这样,前两类二面角的变化就成了讨论主链二面角的关键。根据前两类主链二面角的变化,主链构象分为A,B,P,G,L和E六个类别。并且,每个主链二面角构象类别中的二面角分布都是一个高斯分布,这样每一个分布都可以用一个概率密度函数表示出来。在考虑目标序列中固定部位的主链构象的约束时,就使用六个类别的概率密度函数的一个加权和来表示。其中,每一个类别高斯函数的*均值,标准差和权重都是通过统计分析得到的。Andrej Sali等人[10]使用了一个含有1000个蛋白质的数据集,统计分析了不同残基类型情况下的主链二面角的类别分布,得到了每一个主链构象类别的高斯函数的*均值,标准差和权重三个参数的数据。  1.3其他约束 同源模建方法得到的模型的可靠性很大程度上依赖于目标序列与模板序列的序列一致性。蛋白质超家族成员之间存在的结构差异不仅体现在空位区域上而且还体现在二级结构位置的移位。这就造成了同源模建方法的一个内在局限性。S*t Chakrabarti等人[11]添加远距离模板中的保守片段作为额外的空间约束,在一定程度上改善了基于空间约束的同源模建方法的这一问题。他们使用主流的结构化片段的数据库SMoS,这个数据库整个了许多高保守结构的残基片段。他们利用了数据库中的残基片段的结构信息,将这些结构信息作为额外约束信息添加到同源模建方法中去。BooJALA V B Reddy等人[12]将二级结构信息和氨基酸长距离接触图添加到基于空间约束的蛋白质结构预测的方法中,改善了含有高比例螺旋或折叠结构的蛋白质的预测精度。  2.软件与应用  MODELLER是一款同源模建软件[13]。其中,使用的原理就是基于空间约束的蛋白质结构预测。简而言之,软件的输入项是模板序列与目标序列的比对结果,模板序列的结构文件和脚本文件。然后,MODELLER就能自动计算出目标序列中所有非氢原子的坐标。MODELLER软件中涉及到的空间约束包括:同源约束,立体化学约束,统计约束和其他额外添加的约束。软件没有界面交互系统,只能通过脚本进行使用。  MODWEB是一种自动同源模建的网上服务器[14]。它接收一条以上的FASTA序列,然后在PDB数据库中搜索最可行的模板,并计算出提交的目标序列的模型。MODWEB使用的原理与MODELLER类似,只是在两个步骤进行了改进。它使用的模板搜索方法是序列结构比对,搜索使用的模板也不止一个。对于单个提交序列,MODWEB是通过邮件的形式返回结果。如果提交的序列不止一条或者包含结构时,返回的结果将被作为一个单独的数据集添加到蛋白质模型的相关数据集中。  3.展望  随着越来越多的蛋白质序列的三级结构被测定,同源模建的使用范围也不断扩大。其中,基于空间约束的同源模建方法是在所有同源模建方法中表现最好的方法。目前,对基于空间约束的同源模建方法的研究也越来越深入。许多额外的实验数据约束被添加到方法中来,比如,核磁共振数据,交联试验数据,荧光光谱实验数据,微电子图像重建实验数据和定点突变实验数据。实验数据约束的添加使基于空间约束的同源模建方法的预测结果更加的合理。  总之,基于空间约束的同源模建方法具有能添加多种来源的数据约束的特点,是同源模建方法中与实验数据联系最深的方法,也意味着是最有潜力的方法。  参考文献:  [1] Yang Z, Jeffrey S. The protein structure prediction problem could be solved using the current PDB library[J].Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2005, 102(4):1029-1034.  [2] Bino, John, Andrej, Sali. Comparative protein structure modeling by iterative alignment, model building and model assessment[J].Nucleic Acids Research, 2003, 31(14):3982-3992.  [3] Martí-Renom M A, Stuart A C, Fiser A, et al. Comparative protein structure modeling of genes and genomes[J].Annual Review of Biophysics & Biomolecular Structure, 2000, 29(29):27-30.  [4] Sánchez R, 07ali A. Comparative protein structure modeling as an optimization problem[J]. Journal of Molecular Structure Theochem, 1997:489-496.  [5] Krauli P J, Jones T A. Determination of three-dimensional protein structures from nuclear magnetic resonance data using fragments of known structures[J]. Proteins Structure Function & Bioinformatics, 1987, 2(3):188-201.}

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