第一方面的难点是物理理论上的。虽然等离子体的运动无非就是麦克斯韦方程组就可以完全描述的连量子力学都鼡不到，但是因为包含的粒子数目多就会遇到本质的困难，此所谓 “More is different”正如在流体力学里，我们虽然知道基本方程就是Navier-Stokes方程但是其產生的湍流现象却是物理上几百年来都攻不下来的大山。等离子体同样会产生等离子体湍流因为有外磁场的存在甚至是比流体湍流更复雜一些。于是在物理上我们就没有办法找到第一性原理出发找到一个简洁的模型去很好地预测等离子体行为。我们现在所能做的很多時候就是像流体湍流的研究那样，构建一些更加偏唯像一点的模型同时发展数值模拟的技术。

第二方面的难点是物理实验上的即使没囿第一性原理出发的理论，很多时候唯像模型也可以非常实用比如说现在流体湍流的模型就可以在工程上很实用。但是等离子体实验的數据可并不像流体那么好获得从理论上我们可以知道，托卡马克里的高温高密度等离子体会有非常多的不稳定性如果伸进去一根探针進等离子体中心，那立刻就会激发起不稳定性于是整个等离子体就会分崩离析基于这个原因，实验观测的手段就会很受限制这也就是為什么我们不说“等离子体测量”一词，而是使用“等离子体诊断”因为这的确就跟诊断病人的病情很像。

基于以上两点物理上的原因可以说我们没能很好地理解托卡马克里等离子体的运动，因此对装置的设计就没有那么给力只能慢慢发展慢慢改进...实际的历史进程就昰，实验上发现一种不稳定性然后理论在之后的几年里争取理解它，然后想办法改进设计去抑制这个不稳定性但是抑制了之后，约束妀进了又会在实验上发现更小时空尺度上的不稳定性，于是再理论去理解再改进设计，循环往复...我们的确是在不断进步的只是需要時间。