玩后一个位专业玩彩专家预测号码要怎么做?个位专业玩彩专家预测号码哪个准呢?

农村很多算卦的据说很准,你怎么看?- 百度派
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农村很多算卦的据说很准,你怎么看?
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,此爱隔山海,山海不可阻。微信 LL4LGP
农村似乎就是封建迷信的代名词?然而实际上,我们这边一位“佛祖”,却时常有住在市区的人,开着小车,眼巴巴地上门,希望能够得到“佛祖”的指点。而这里面,也有一些类似算卦算得准的意味吧。而得到了“...
农村似乎就是封建迷信的代名词?然而实际上,我们这边一位“佛祖”,却时常有住在市区的人,开着小车,眼巴巴地上门,希望能够得到“佛祖”的指点。而这里面,也有一些类似算卦算得准的意味吧。而得到了“指点”的人,也往往会心满意足的离去,然后等到推算应验的时候,再口口相处把“佛祖”的名气传了出去,让更多人来接受这样的指点。但是实际上,现在算过的人大多都是用着心理学概率学还有逻辑学等方面的知识应用到自己的“算卦”之中,并不是简单的封建迷信,如果你没有这方面的知识,还真的很容易被忽悠,然后觉得他们算卦算的很准。当然,如果他们算卦算的不准的话,还怎么养活自己呢?这可是人家混饭吃的伎俩。见人说人话,见鬼说鬼话,说的就是他们这一行。看人下菜是他们最基本的技能。凡是要来问卦的,基本上都会有所求。无非就是工作、学习、姻缘、家人、健康等等……算卦的人一般都会先看一看,您究竟是什么身份,有什么样的特点,可能问哪些方面的问题。然后再根据你的实际去做一些判断,然后说出一些似是而非的推断。想一想,一个60多岁的老头来问你个30岁的儿子的事情,你猜,会问什么?这个就需要考究你的功力了。30岁的儿子应该在社会上打拼了一段时间,所以工作应该是不愁的。而现在社会的发展已经到了越来越多人单身的时候,特别是在外面城市发展的人,大龄单身未婚的男女青年是越来越多了。如果你开口就是一句嗯,来问你儿子的姻缘呢是吧?你猜对方会不会觉得你算卦很准?当然这话也不是随便说的,起码都是有一定的认识跟了解之后才会下这样的判断。而只要你最开头的一棒打出去,命中了之后,对方对你的话也一定会提高信任度了。接着就是常规的套路了。先说不好的,说你有大灾大厄大难,让你担心。然后又说听自己的就可以有方法解决。要解决的话当然需要你给出一点点辛苦费了……这里面的套路太多了,我就不详细介绍了,免得给更多的人提供了行骗的方法跟伎俩,给他们进修的机会……实际上去算卦的人,大多都是盲目的,想要求得心灵上的指引。所以,就好像在溺水的时候,有人给了一个救生圈,会牢牢的去抓住它。对待算卦也是这样……
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,人生若只如初见,何事秋风悲画扇
我就听说过很多算卦算得特别好的人,还是被算过的,当然不是我本人去的,是我妈拿着我的生辰八字算的。其中有一个被传的特别神奇,此人就在我老家的隔壁村,据说算卦远近闻名,有多少外地的人都开着车去找...
我就听说过很多算卦算得特别好的人,还是被算过的,当然不是我本人去的,是我妈拿着我的生辰八字算的。其中有一个被传的特别神奇,此人就在我老家的隔壁村,据说算卦远近闻名,有多少外地的人都开着车去找他算,此人每天算的卦数有限,算够了就不再算,所以大家才会早早就去排队。具体算得准到什么程度呢,也是有实例依据的,据说他有一次给一位寡妇算命,说这位寡妇命中克夫,要克死自己的三个丈夫,而这位寡妇其实去算命时已经死了两位丈夫,这可如何是好,算命先生也会她支招了,说你第三次结婚不妨先跟一颗大树结婚吧。这位寡妇回去了便依计行事跟一颗大树成了亲,果然过了没有多久,这颗大树就死了。诸如此类的事情还有很多,慢慢的就越传越神,知名度越来越高,我妈闻信就去也给我算了卦,回来还把先生的讲解给我记录了下来。我虽然不怎么信这个,但还是觉得算卦的是有一定依据的,所谓“存在即合理”。算命在我国由来已久,天干地支、生辰八字、五行八卦等这些也是我国传统文化的一部分,也融入了我国古人智慧。虽然很多人表示我命由己不由天,但很多命中注定的事情是不能改变的,比如说我为什么会出生在一个这样的家庭而非富豪家里或者是乞丐家中,所以只所以有那么多人相信算卦,还是说明他们说的有一定道理。比如说一个人未来的发展,很多时候是通过这个人的性格等细节就能大体上看出来的,算卦的也大部分都是很会察言观色的,所谓:“性格决定命运”也就是这么回事。虽说算卦有一定道理,但也不能全信,只所以被传的那么神,大抵也是因为算的灵验的都被广为流传,算得不准的也就被忽视的缘故吧。人活在世就是这样,有一部分是命中注定的,有一部分则是可以事在人为的,如果被算了卦就存在了心里暗示,算得好的就觉得不努力就能成功,被算得不好就自暴自弃,那也就失去算卦的意义了。之前就听过一件事,说的是一个大院里有几个马上要参加高考的学子,一天院里来了一位算卦先生,给他们几人算了一卦,果然被他算中能考上大学的几个都考上了,不被算中的也就没有考上,这大概也是受了一定程度的心里暗示吧。不管怎样,后天的努力在个人的成才路上还是占很大一部分比例的,切不可完全听信算卦的。
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,关注彭友圈:15 75 11 49,为你答疑解惑
关注彭友圈:15 75 11 49,为你答疑解惑!很多算卦的都很准,这事情是真的。易学分为象数和义理两大流派。易经的主要用途就是趋吉避凶。象数派多用易学进行占卜,从而想预知后事;义理派则从中寻找一些道理...
关注彭友圈:15 75 11 49,为你答疑解惑!很多算卦的都很准,这事情是真的。易学分为象数和义理两大流派。易经的主要用途就是趋吉避凶。象数派多用易学进行占卜,从而想预知后事;义理派则从中寻找一些道理,作为自己处事的依据,从而趋吉避凶。无论是象数还是义理,在学习和应用易经的时候,都是感性思维理性思维并重,从中找到一个可靠的结论来。比如说,你问要去何方?占得坤卦,坤为西南,大抵是去西南。固然这是一种类比,但在你问这个问题的时候,给你解卦的人也是站在你的角度,了解了你的详细信息,然后才结合卦给你做出的一种判断。现在网络方便,占卜通过在线起卦,卦师不能和问事者面对面,只是通过一个卦象去告诉你结论,准确率就大大下降了,为什么呢?这就是因为,见不到这个人,没有给卦师留下重要的“第一印象”,对卦的解读,缺少潜意识中“第一印象”给卦师的启发。所以,信息不全,卦就不准。所以,我们学习易经是为了趋吉避凶不佳,那是要好好学习一些做人的道理,把现在的每一步走好,能够有一个很好的心态面对未来发生的每一件事。即使发生了不好的事,我们也能坦然面对,这样还用那么在意未来的不可测吗?把现在的每一步走好,也能够让未来变得更好一点。今天在从恶和从善之间,你选择了善,明天你还选择善,以后一直选择善,未来自然是吉无不利的。这不就是做到趋吉避凶了吗!希望我的回答对你有帮助
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,静水流深
对于算卦这件事儿当然是说有真有假,但是题目中提到是农村那我就不得不说他如果真的只是个骗子或者神棍,在村里是不可能“驻扎”得下去的。所以但凡是口碑好的“先生”真的都值得尊敬的,毕竟有些东西咱们...
对于算卦这件事儿当然是说有真有假,但是题目中提到是农村那我就不得不说他如果真的只是个骗子或者神棍,在村里是不可能“驻扎”得下去的。所以但凡是口碑好的“先生”真的都值得尊敬的,毕竟有些东西咱们凡人是看不到的。我就说个远房的亲戚,他现在虽然不在村子里面住,但是确实是在他拜了庙里面的师傅之后变得有些“本事”了。那时候,我第一次看见他的时候他问我为什么不加他qq,我还在想这个人像极了二溜子就糊弄着说没有看见,后来有一次大家都回去串门子顺便祭祖寄住在他家的时候,大家都发现他从原本流里流气的样子变得有“佛相”了。当他们细聊之后才知道,原来在爱情婚姻事业上面全部不顺心的他,在一次机缘之后遇见了现在的师傅**大和尚,那时候他只是没事去庙里烧烧香做做义工,慢慢地放生参加一些法会,最后因为他真的和别人不太一样,于是乎**大和尚就把他收成了弟子。当然这期间他有一些香火,但并不是师傅强要的,而他有本事之后也只是帮助善良的人,比如找个遗失耳环,比如寻个走丢的亲戚,再比如夫妻没有孩子等等,他做的不过是相面和六爻,也就是上面说的“算卦”。这里要说的是,一般他都是免费帮忙的,只不过很多人灵验了之后会象征性的给他一些东西,但是他是善良的从来不会害人也不会去强制的让人信奉什么。至于说,他真的是不是会一些“奇闻秘术”我没有亲眼见过也不知道,总之这世间有真有假只要能够帮助到人,并且不为了盈利那么我都是支持的。毕竟,世界上有太多科学解释不了的东西。对吧~
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,火兼文武调元手,药辨君臣济世心
关于农村占卜的故事,其实也有很多的,现在有些人一直觉得占卜术是不科学的,只是一些迷信而已罢了。但是我想说虽然有些东西现在我们根本无法用科学来解释,但是这并不代表这些东西一定就是错的。
关于农村占卜的故事,其实也有很多的,现在有些人一直觉得占卜术是不科学的,只是一些迷信而已罢了。但是我想说虽然有些东西现在我们根本无法用科学来解释,但是这并不代表这些东西一定就是错的。& & &我在老家的时候,就曾经有个这样一件事情,当时我有个亲戚是开车的,他经常要去外地所以有时就去打平安符,那次他去吉林到粮食,外出前就是去经常去的地方打符,那个老太太告诉他,这趟买卖不能太贪,差不多就行了要不然会破财的,而且在省道上开车一定要多加小心,因为这次有些麻烦。后来这个人就去了,前头的时候还挺顺利的,后来在黑吉交界上天开始黑了,他和另一个人交替的开车和睡觉,结果到了晚上果然出事了,一个人说一直觉得前面有个人,一近看就没了,后来我那个亲戚就把平安符挂在车窗上,说不可能有人,这都半夜了,就是有人被咱俩撞了,也是他的事情这里是高速公路,不是行人该走的路。后来我那个亲戚开车就是感觉异常他也不管,一直开车,直到第二天早上什么事都没了。后来去砍价买给的价钱不太高,比起,现在的行情有些少,大多数人都觉得肯定会涨价的,但是他就卖了,结果不到一个星期就开始掉价,我那个亲戚还是很赚钱的。& & &后来此事在我家的时候成为了谈资,人们都是这真是神奇,其实有些东西就是这样你觉得不科学,是因为你无法解释。
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,唯愿世间所有爱与被爱皆恒久
八卦起源于上古时期的河图洛书,后经文王既历代“诸贤”的发展成为一种预测学科,在中国这片悠久的而适宜的土壤里经久不衰,中国人讲究“命里有时终须有,命里无时莫强求”!时至今日,它依然生机勃勃,尤...
八卦起源于上古时期的河图洛书,后经文王既历代“诸贤”的发展成为一种预测学科,在中国这片悠久的而适宜的土壤里经久不衰,中国人讲究“命里有时终须有,命里无时莫强求”!时至今日,它依然生机勃勃,尤其在农村。多年前在农村我曾结识一位预测神准的老先生。首先他是一位在十里八乡学识还算“富五车”的文化人,年轻时五湖四海走过不少地方,后来回到家乡开始算命看风水的行当,算了几年后在乡间声名鹊起。乡里人小到鸡毛蒜皮丢东落西,大到查吉问凶求财驱病,都得去他那里走一遭。由于某种机缘,我曾在其身边待过些时日,此人尤善察言观色,据来者衣着打扮、愁容倦态、身形体貌,甚至一句话、一息声都能读进你的故事,探透你的诉求,继而展开他的预测。他一般语速很慢,边算边据你的神态变化而转换预测方向,直到你颔首、惊奇,再指导你以后该何去何从……于我眼见而言,他更像是一位鉴赏家、一位阅历丰厚的心理大师。求算者立于他面前犹如一件待赏器具,他先读你,再指引你……你终于迷途知返或达成如愿,满意而归……历史上的预测虽有遗害不菲,也曾补充完善了人类的文明,能绵延传承至今,自有它生长的道理,在此不敢枉断真伪。但就现在农村算命之事,本人以为更确切的名字当叫做心理咨询服务。准与不准姑且先放一放,人在迷途无助时,确实需要他们言语的慰藉。只要对人有益而又不以害人利己为目的,还是该宽容他们的存在!
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【求助】抗原决定簇(抗原表位)预测比较?请高手帮助,谢谢!!!
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这个帖子发布于7年零312天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
我利用http://imed.med.ucm.es/Tools/antigenic.pl预测的蛋白质的抗原决定簇和我利用DNAstar-protean利用antigenic index 预测的抗原表位全不相同,这是为什么?请高手指导啊!我想根据蛋白质序列合成多肽免疫动物用,应该怎么设计多肽啊,也请高手指导啊!在这里先感谢大家了!!!:)
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本人也正在做这方面的工作,因为是初次接触免疫学放面的知识,一路坎坷。查了不少这方面的东东,与你分享一下吧,不知是否有帮助?都是从各文献总结的。1、B细胞表位预测对于多种免疫学研究是必不可少的。针对不同的蛋白,应选择不同的方法。一般来说,蛋白质的C端具有较好的亲水性、表面可及性和柔性,所以是很好的抗原决定簇区域。本课题选用的蛋白质C-末端序列标签都是唯一的、或是其家族中的几个成员所共有的。在人蛋白质中,约81%的蛋白质其C末端的5个氨基酸残基的小肽是该蛋白质所特有的,制备针对蛋白质C末端小肽的抗体,常常能得到特异性识别该全蛋白的抗体。另外,蛋白的二级结构是B细胞表位计算机预测的重要参数之一,β转角为凸出结构,多出现在蛋白质抗原表面,有利于与抗体结合,较可能成为抗原表位。而α螺旋和β折叠结构规则不易变形,较难结合抗体,一般不作为抗原表位。含有5个以上的氨基酸残基的转角又常称为环(loop)。以往的研究表明,蛋白表面的loop区可能为功能性抗体的识别位点,特异性好,可及性强。本课题选用的HPO、G-CSF、HSA空间结构已明确,所以直接选择loop区或无规卷曲作为B细胞表位。举例:人Pif1基因编码至少两种蛋白亚型,分子量分别为74kDa和80kDa,与酵母具有高度的同源性,α型和β型Pif1只有C末端不同[20],其余部分完全相同,并且二者的C末端在蛋白数据库中都是唯一的,选择α型和β型的C末端作为B细胞表位,既满足特异性的需要,也能区分亚型。GPAA1是一种跨膜蛋白,原核表达非常困难,形成包涵体,且包涵体难以溶解和复性。对这一类型的蛋白,非常适合选择其特有的B细胞表位免疫动物,来最终制备识别全蛋白质的抗体。ABCpred是基于人工神经网络模型的线性B细胞表位预测工具,该系统检验了源于Bcipep数据库的700个非冗余B细胞表位和源于Swiss-Prot数据库的700个长度为10~20个氨基酸的随机选择多肽,准确率近66%。Bepipred结合隐马尔科夫模型和亲水性参数评分预测线性B细胞表位,AROC评分达到0.671。将两种预测方法得到的预测结果进行比较,其共有的预测表位是真正B细胞表位的几率更大,如果能进一步结合蛋白质二级结构预测结果,就可以选出可信度更高的B细胞表位。如何选择有效的B细胞表位是能否实现无完整蛋白质抗原条件下抗体制备的关键。2、对于B细胞表位的选择,对于已有空间结构信息的蛋白质抗原,直接选择蛋白分子表面的loop区或无规卷曲区域的小肽序列作为候选B细胞表位;对于缺乏空间结构信息的蛋白质抗原,需要根据蛋白质抗原的特点具体分析。若蛋白质抗原C末端的序列亲水性好,可以选择C末端的6~10个氨基酸的序列作为候选B细胞表位,并且最好该序列为该蛋白质所特有;也可采用B细胞表位预测程序进行分析,选择不同程序预测的共有B细胞表位;对于同源性很高的家族蛋白,根据序列比对结果选择差异较大的区域,并且所选序列应该符合B细胞表位的特征。基于以上原则,本实验选择了10个蛋白的14个表位,并对其中的12个表位进行了验证。3、对于B细胞表位的选择,(1)对于空间结构已知的蛋白质,直接选择蛋白分子表面的loop区或无规卷曲区域的小肽序列。(2)对于空间结构未知的蛋白质,可采用以下策略进行选择:A:若蛋白质C末端序列的亲水性好,可以选择C末端的6~10氨基酸的序列作为候选B细胞表位,最好该序列为该蛋白质所特有。可采用SIB BLASTNetwork Service(http://www.expasy.ch/tools/blast/)的BLAST软件进行比对,数据库选择homo sapiens;B:采用B细胞表位预测程序ABCpred和BepiPred等进行表位预测,选择不同程序预测的共有B细胞表位;C:对于同源性很高的蛋白质,首先根据序列比对结果选择差异较大的区段,并且所选序列应该符合B细胞表位的特征。4、二级结构预测 分别应用EX-PASY服务器(http: //www. expasy. org/tools)上的GOR4[4]、HNN (Hierarchical Neural Network meth-od)、SOPMA、nnPredict[University ofCalifornia atSanFrancisco (UCSF)]等方法。
亲水性、柔韧性、表面可能性和抗原表位预测 应用DNAstar软件的子程序Protean,采用Hopp-Woods和Kyte-Doolittle方案预测氨基酸的亲水性[5, 6],采用Karplus-Schultz和Emini方案预测柔韧性及表面可能性[7, 8],采用Jameson-Wolf方案[9]和吴氏抗原指数法[10]预测潜在的B细胞抗原表位。5、 对获取序列的生物信息学处理分析  使用DNASTAR软件分析获取的序列,结合NCBI上的BLAST寻找最匹配的短序列。用全部和部分肽序列查询各国专利数据库:  http: //appft1. uspto. gov/netahtml/PTO/search-adv. ht/  http: //www. freepatentsonline. com /5194592. htm /  http: //www. stcsm. gov. cn/resource/data/zhuanl.i asp#1  使用蛋白质在线分析工具分析多肽的疏水性、PI值、稳定性:  http: //www. expasy. org/  http: //www. rcsb. org/pdb/cgi/explore. cg?i pdbId=1fi6  http: //www. rcsb. org/pdb/search/searchSequence. do  http: //www. expasy. org/sitemap. html  http: //www. expasy. org/tools/#translate  http: //www. expasy. org/tools/blast/常用数据库和预测工具:名称 网址 说明ABCpred
人工神经网络线性B 细胞表位预测工具AgAbDb
1.70.51:8080/agabdb2/ 抗原-抗体共结晶结构的分子相互作用数据库AntiJen
B 细胞表位定量结合数据库Bcipep
B 细胞表位数据库Bepipred
基于序列的线性表位预测工具CEP
基于结构的连续性和非连续性表位预测工具DiscoTope
基于序列/结构的非连续性表位预测工具Epitome
抗原-抗体相互作用残基数据库HIV database
HIV免疫表位数据库IEDB
T细胞和B细胞表位数据库含阴性数据IEDB B-cell
基于序列的线性表位预测工具
epitope tools6、B细胞表位预测的方法及应用线性表位的预测方法B细胞表位的预测方法主要集中于线性表位,在二十世纪七、八十年代发展起来的大量的预测B细胞表位的算法都是基于蛋白质序列。这些算法包括:⑴蛋白质的亲水性算法(Hydrophilicity):认为蛋白质各氨基酸残基可分为亲水残基和疏水残基两类。在机体内,疏水性残基一般被埋在蛋白内部,而亲水性残基位于蛋白质表面,因此,蛋白的亲水部位与蛋白抗原表位有着密切的联系。Hopp-Woods(Hoop TP et al.,1981)算法为最常用的。⑵可及性算法(Accessibility):常用的有Janin可及性参数,即指蛋白质抗原中氨基酸残基被溶剂分子接触的可能性(Rudolph R et al.,1990)。它反映了蛋白质抗原各个氨基酸残基的分布情况。⑶蛋白质可塑性算法(Flexibility):此算法认为蛋白质抗原构象的多肽链骨架具有一定程度的活动性,活动性强的氨基酸残基即可塑性大,易形成抗原表位(Karplus PA et al.,1985)。⑷蛋白质二级结构预测算法(Secondary structure):该算法认为蛋白质二级结构与蛋白质表位的分布关系密切。α螺旋、β折叠化学键键能比较高,形态固定,常处于蛋白质内部,难以与抗体嵌合,而β转角和无规则卷曲多处于蛋白质的表面,结构松散,易展示在蛋白质表面,有利于与抗体嵌合,成为抗原表位的可能性大(来鲁华,1993)。⑸蛋白质抗原性算法(Antigenicity):Welling(Welling GW.,1985)通过对20个已研究得很透的蛋白质的69个连续位点的606个氨基酸统计分析,用各氨基酸残基在已知B细胞表位中出现的百分率与其通常在蛋白质中出现的百分率比值的对数建立了抗原性刻度,并以此计算蛋白中各亚序列的抗原性。这些方法的代表软件有PEOPLE(Alix AJ et al.,1999)、PREDITOP(Pellequer JL et al.,1993)、BEPITOPE(Odorico M et al.,2003)、Bcepred(Saha S et al.,2004)等。但是最近Blythe及Flower(Blythe MJ et al.,2005)对氨基酸的性质与线性表位的关系做了一个评估,结果表明基于氨基酸序列信息来预测线性表位,即使很好的结合了氨基酸的各种性质,其预测结果仅略强于随机预测。近年来,一些应用隐形马尔可夫模型(HMM)、人工神经网络(ANN)、支持向量机算法(SVM)及其他技术的机器研究方法(Ponomarenko JV et al.,2007)已经被引入来预测B细胞表位,取得了较好的结果。代表软件有ABCpred(Saha S et al.,2006)、BepiPred(Larsen JEet al.,2006)、APP(Chen J et al.,2007)等。ABCpred采用人工神经网络来预测线性表位,从Bcipep和SwissProt数据库中提取非冗余的表位肽和非表位肽作为训练集,采用5-折交叉验证,预测敏感性约为67%,特异性约为64%。BepiPred结合氨基酸的性质(亲水性、柔韧性、可及性、极性、暴露表面、转角)和隐形马尔可夫模型来预测线性表位,预测结果表明,同那些仅依赖于氨基酸性质的预测方法相比,BepiPred预测结果的准确性有一定程度的提高。Chen et al.(2007)发现氨基酸通常成对出现在抗原表位的频率要比其出现在非表位肽段的频率高,基于此,并联合支持向量机算法建立了APP方法。应用此方法在872个表位肽和872个非表位肽数据集中,采用5-折交叉验证,预测准确度为71%。Yasser EL-Manzalawy(EL-Manzalawy Y et al.,2008)等采用同一数据集对这三种方法进行比较,结果表明ABCpred预测表位的准确性略高于BepiPred及APP。构象表位的预测方法目前,绝大多数B细胞表位预测方法都是基于蛋白质的一级或二级结构的,但这些方法只能用来预测由连续的氨基酸残基构成的线性表位,而基于蛋白质的三级结构来预测构象表位的方法比较少,这是因为各种抗原的构象表位可获得的数据要远远少于线性表位,并且到目前为止,几乎没有哪个抗原的所有的表位都能够彻底的研究清楚(HasteAndersen P et al.,2006)。基于蛋白质三级结构来预测构象表位的方法CEP(Kulkarni-Kale U et al.,2005)(Conformational Epitope Prediction):这是第一个以抗原蛋白的三级结构PDB文件作为输入条件,以构象性表位预测为主要目的的网上免费服务软件。它提供了一个预测构象表位的web界面,这种方法除了能够预测构象表位,同时也能预测线性表位。它主要根据氨基酸残基的溶剂可及性及空间距离截值来预测表位,其公布的预测精度达75%。DiscoTope(Haste Andersen P et al.,2006):是通过蛋白质三级结构数据来预测构象表位的一种新方法,这种方法通过对X射线晶体衍射确定的76个抗原抗体复合物所组成的构象表位数据集进行大量统计度量、空间特征分析和表面可及性计算,对B细胞构象性表位进行预测,最终对组成蛋白序列的每个氨基酸打分,通过分值来反映某一氨基酸成为表位的可能性,并提供了阈值来确定组成表位的氨基酸残基。预测蛋白质与蛋白质相互作用位点的方法除以上两种方法之外,还有最近发展起来的一些预测蛋白质与蛋白质相互作用位点的方法。由于抗原抗体之间的相互作用属于蛋白质与蛋白质之间相互作用中的一种,因此,可以参这些方法来预测B细胞表位。分子对接:主要用来研究分子间的相互作用与识别,进而预测复合物结构。常用的分子对接软件有ZDOCK(Chen R et al.,2003)、DOT(Shoichet BK et al.,1991)、DOCK(Mandell JG et al.,2001)、ClusPro(Comeau SR et al.,2004)等。其中ClusPro是一个提供网上服务的分子对接软件,其能够根据形状互补快速的筛选ZDOCK和DOT程序产生的对接结果,并对对接结果聚类,根据聚类情况对对接结果打分,最终返回10个得分最高的对接结果,再根据这些对接结果来确定蛋白质相互作用的位点。PPI-Pred(Bradford JR et al.,2005)(protein-protein interface prediction)将支持向量机的方法同曲面分析结合在一起预测蛋白质相互作用位点。ProMate(Neuvirth H et al.,2004)(Predicting the location of potential protein-protein binding sitesfor unbound proteins)是将一些蛋白质相互作用界面的重要性质综合起来预测蛋白质相互作用位点。这些性质包括:结合位点通常偏向位于β片层及非结构的链;芳香族氨基酸的侧链常会参与蛋白质与蛋白质的相互作用;疏水氨基酸和极性氨基酸常聚集在蛋白质与蛋白质相互作用的界面;以及在晶体结构中结合位点的周围有更多的水分子与之结合。Ponomarenko和Bourne采用以上几种方法预测构象表位并使用同一评估体系对其进行了比较,结果表明,这些方法的准确性均未超过40%,如果用ROC(Relative operating characteristic)曲线下面积的值来评估这些方法,则DiscoTope,和PPI-PRED的值大约是0.6,ClusPro的值高于0.65,但未超过0.7,而其它的方法接近于随机预测。尽管这些年来B细胞表位预测的方法得到了一定的发展和应用,但这些研究方法还存在一定的问题。首先,所有预测表位的方法都缺乏标准的ROC(Swets JAet al.,1988)评估,这使得各种预测方法的结果难以比较与评估;其次,大多数预测线性表位的方法都具有一定的局限性,它们仅仅是根据少数的几个表位的特征(氨基酸的性质,残基的表面可及性,空间分布,分子间接触)来预测表位,而最近对各种线性表位预测方法进行评估的结果表明,仅根据氨基酸的性质来预测线性表位的方法并不可靠。要想提高预测的准确性,需将更多表位区别于非表位的特征结合起来预测;最后,目前预测表位的方法大多数是针对于线性表位的,而据研究表明(Barlow DJ etal.,1986)90%以上的表位为构象表位,因此在进一步完善线性B细胞表位预测研究的基础上,从蛋白质的三级结构入手,深入对构象性B细胞表位预测算法与程序的研究。同时,我们也相信随着PDB数据库中抗原抗体复合物的增加,能够对各种抗原的构象表位进行更广泛的分析,人们对蛋白质抗原表位的研究将更加透彻。以上都是前辈们总结的,我只是借平台和同我一样迷茫的人们一起分享,希望有助于解决问题。但有一点,大多数软件预测得到的是线性表位,需要构像表位,最好结合噬菌体肽库筛选。
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我是做疫苗研究的,根据自己做抗原多肽的经验,认为选择抗原多肽有如下基本原则:1、尽可能是在蛋白表面2、保证该段序列不形成α-helix3、N,C端的肽段比中间的肽段更好4、避免蛋白内部重复或接近重复段的序列5、避免同源性太强的肽段6、交联可以交联在N、C两端,选择依据就是交联在对产生抗体不太重要的一端7、序列中不能有太多的Pro,但有一两个Pro有好处,可以使肽链结构相对稳定一些,对产生特异性抗体有益。
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这个很正常。不同的软件算法不一样。建议参考文献,选择一个大家用得比较多的、公认的预测软件。而且预测的比较是虚拟的,只有多选几个进行动物试验,才能确定。
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