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& 现代日本人为何钟情于悲剧英雄
现代日本人为何钟情于悲剧英雄
摘要:在日本历史上，当属战国时期的织田信长?丰臣秀吉时代和幕末最具人气。其中，日本人最怀念的是那些无法如愿完成人生使命、中途夭折的悲剧英雄，你知道为什么吗？
德川家康VS石田三成（“胜”）、山县有朋VS坂本龙马（“胜”）
在日本历史上，当属战国时期的织田信长?丰臣秀吉时代和幕末最具人气。其中，日本人最怀念的是那些无法如愿完成人生使命、中途夭折的悲剧英雄，如关原之战中战败而死的石田三成、大阪夏之阵中的真田幸村等。而一举开创江户幕府的德川家康和明治维新功臣——伊藤博文、山县有朋却未能获得亲睐。
那么，这是为什么呢？或许是现代人的“同病相怜”知心作祟吧？！现实生活中，即便自己拼命工作、努力生活，也未必能得到社会认可。久而久之，人心逐渐麻木，终日疲于奔命而不知为谁辛苦为谁忙，最初的梦想与希望的实现遥遥无期。而在那些人生遭遇挫折的历史人物身上，很多人找到了自己的影子。这可能就是现代日本人钟情于悲剧英雄的一个原因吧！
从“恐怖组织”到幕末英雄的转变
山形蓝羽衣是他们的标志，义是他们的守则，幕末乱世中如樱花般绚烂而命运多舛的亦是日本人心目中挥之不去的“真英雄”。然而，在日本近代化进程中，明治维新被认为是唯一正道，“逆行倒施”的新选组则被冠以“恐怖组织”的恶名。今日，不少文学、影视作品皆以新选组为题材，但它以成功完成了从“恐怖组织”到幕末英雄的转变。
日本人对樱花、武士道、的喜爱，或许都出自同一个原因，你发现了吗？（日本通编译，转载请附原文链接）
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本帖最后由 jetding 于
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从PS2时代就接触了很多日本幕末时代为背景的作品，其中最著名、最引人注目的的就要数新选组了。所以后来看了很多文章，也读了一些关于新选组的书籍，对这个神秘的组织有了详细的了解。这时恰逢如龙维新推出了，本人身为如龙和新选组的粉丝，非常兴奋。所以写了篇帖子，大概科普一下新选组这个幕末最强的斩人集团。我尽量精简新选组的主要脉络，让大家了解一下他们的主要故事。如果有哪些写的不对的，还请指出见谅，谢谢。
首先介绍下时代背景。
幕末时期：开始于嘉永六年（1853年），日本从德川幕府就开始了200多年的锁国政策在这个时候被打破，一支美国舰队冲进了江户的浦贺冲，武力要求日本开国，幕府无力抵抗，同意开国，被迫签订了《日美和亲条约》等一系列不平等条约，引得日本国内一片哗然，幕府受到猛烈的指责，日本国内顿时掀起一片尊攘（支持天皇，抵制列强）的怒潮，幕末这个动荡的时代由此开次。
天皇和幕府：这里简单介绍一下天皇和幕府的关系，天皇其实就是日本的最高统治者（类似于中国的皇帝），但在幕府时代，天皇只是一个象征，摆设。没有任何实权。而幕府掌握着日本的实权，幕府的最高统治者就是将军。换句话来解释，幕府将军和天皇的关系就像是三国时代的曹操和汉献帝，曹操虽身为丞相但控制着所有实权。天皇的御所在京都，幕府的根据地则在江户。
尊攘派，开国派，倒幕派，佐幕派：尊攘，全名尊王攘夷，意思就是拥戴天皇、抵制外国列强。而开国派主要就是支持开国，和外国交流、通商，学习国外先进技术。到了后期尊攘派逐渐转变为倒幕派，要恢复天皇的威信必须要打到幕府。而开国派转变为佐幕派，就是要保护幕府的权威不被侵犯。
新选组：又名新撰组，日本幕末时期一个亲幕府的武士组织，在成立初期得到当时担任京都守护职的会津藩主松平容保支持，并纳入会津藩编制。主要在京都活动，负责维持当地治安，对付反幕府人士。新选组最为人所知的特色是“诚”字队旗、青白衣（衣袖上印有山形图案的独特羽织）和“局中法度五条”。
新选组的组织编制受西式军制影响，最高首领是局长，以副长（副局长）辅助，以下再设副长助勤、监察方（负责情报工作）和勘定方（负责会计）等职位。副长助勤是统率一个小组的组长。新选组共有10个分组，编号从一番到十番，每组约有10人。组长以下又设置伍长。
在这里附上新选组主要干部资料，方便大家对号：）
姓名职务生卒出生地所属流派近藤勇局长武州多摩郡天然理心流山南敬助 总长
陆奥国仙台 北辰一刀流 伊东甲子太郎 参谋
常陆志巩藩 北辰一刀流 土方岁三 副长
武藏国多摩郡 天然理心流 冲田总司 一番队长
江户白河藩 天然理心流 永仓新八 二番队长
松前藩 神道无念流 斋藤一 三番队长
明石藩 无外流、一刀流 松原忠司 四番队长
播州小野藩 不明 武田观柳斋 五番队长
出云国 北辰一刀流 井山源三郎 六番队长
武州日野宿北原 天然理心流 谷三十郎 七番队长 ？-1866 备中松山藩 神明流 藤堂平助 八番队长
武藏国江户 北辰一刀流 铃木三树三郎 九番队长
常陆志巩藩 北辰一刀流 原田左之助 十番队长
伊予松山藩 种田流枪术 山崎烝 役兼监察
摄津国大阪 不明 岛田魁 监察
美浓国方县郡 心形刀流 尾形俊太郎 监察 不明 肥后国 不明 河合耆三郎 勘定方
摄津国大阪 不明 市村铁之助 副长小姓 1854-？ 美浓国大垣藩 不明 市村辰之助 会计 不明 美浓国大垣藩 不明
主要人物简介：
孝明天皇：明治天皇裕仁的父亲，孝明天皇拥有强烈的攘夷思想，极度反对开国，这也是尊王攘夷思想的开端。其实孝明天皇严格来说不能算是倒幕派，他一直推崇的是公武合体思想，即是天皇和幕府联合统治日本，可能也因为这样，有传闻说孝明天皇是被毒杀的。因为他死后，倒幕派就正式的站上了历史的舞台。
明治天皇：孝明天皇的第二皇子，年幼时继位，宣布了“王政复古大号令”，大力推行明治维新改革，倒幕派名义上的最高领导者。
坂本龙马：倒幕维新派的关键人物，先加入了土佐勤王党，后脱藩和中冈慎太郎成立了陆援队、海援队，利用贸易支援萨摩藩的尊攘活动。其主要贡献是促成了萨长同盟，也就是日后倒幕军的主力，并提出了船中八策。坂本龙马一生致力于和平政权交替的实现，认为日本人自己应该避免内战，以防外国列强趁乱介入日本内政。坂本龙马在近江屋事件中被京都见回组刺杀，享年32岁。
中冈慎太郎：萨摩藩士，坂本龙马的盟友，明治维新的重要人物。曾经加入武士半平太的土佐勤王党，后创办了陆援队，鼓吹改革的中心在于一个“战”字，1867年11月，和坂本龙马一起死于近江屋事件。
西乡隆盛（吉之助）：萨摩藩士，幕末后期倒幕派的领袖，维新三杰之一，曾经认同公武合体思想，但在萨长同盟结成后成为了倒幕的主力军。西乡隆盛的主要战绩是在第一次长州征伐中提出了不战而胜的提案，并在攻打江户城的时候终止了总进攻，实现了无血开城。倒幕战争胜利后，西乡隆盛因不满大久保利通等人专政离开了新政府，并成为了西南战争的盟主，最终战败后切腹。
大久保利通：萨摩藩士，西乡隆盛的战友，维新三杰之一，明治维新的第一政客，曾在鸟羽伏见之战中制作了天皇的锦御旗。倒幕胜利后与西乡隆盛断绝关系，1878年大久保利通被刺杀，他的死也标志着明治维新的正式结束。
桂小五郎：又名木户孝允，长州藩的领袖，维新三杰之一，武艺和谋略俱佳。因为在池田屋事件和蛤御门之变中，为保存实力而逃脱，被赠外号“长跑小五郎”。桂小五郎的艺妓情人“几松”也相当有名，常充当他的信息联络员，为倒幕间接做出了贡献。
高杉晋作：长州藩士，创办了奇兵队（除新选组外，唯一一个不论身份和阶级的武装）。在功山寺举兵中打败了俗论派，使得长州藩重新走上了倒幕的道路，并在第二次长州征伐中带领长州战胜了幕府。在大政奉还的前一年，死于肺结核，享年27岁。
德川家茂：江户幕府第14代征夷大将军，由于在幕末初期支持开国，因此引来了尊攘派人士的声讨，在第二次长州征伐中暴病身亡。
德川庆喜：江户幕府第15代将军，也是幕府的末代将军。刚刚上任即应对新政府的“王政复古大号令”（天皇重新掌握国家的实权），在经历了鸟羽伏见等战的失败后，向新政府投降，实现了江户的无血开城。
松平容保：会津藩主，佐幕派的重量级人物，手下有闻名天下的新选组和京都见回组。因为主导过蛤御门之变和幕长战争，被长州等雄藩恨之入骨。德川庆喜投降后，松平容保被认定为“朝敌”，继续抗争新政府，最后在会津战争战败后投降。
胜海舟：又名胜麟太郎，坂本龙马的老师，幕府陆军总裁，典型开国派。年轻时曾去美国游览，因此积极主张学习列强的先进知识和技术。后在鸟羽伏见之战后，成功劝服德川庆喜投降，实现了江户无血开城。
榎本武扬：佐幕派，幕府海军中将，精通外语。在会津战争失败后带军舰占领了虾夷（北海道），并担任虾夷共和国大总统，最终投降新政府。
近藤勇：幼名胜五郎，天然理心流第四代掌门人，剑术高超，有野心，创建了新选组并任局长。因为他出生于多摩农民家，离江户很近，所以从小耳濡墨染有着对幕府的绝对忠诚。下总流山一战中，为掩护同伴成功撤退，投降新政府军后被斩首，享年35岁。
土方岁三：人称“魔鬼副长”，近藤勇的左右手，也是新选组的灵魂人物，不仅剑术高超，而且工于心计，为达目的不择手段。起草了著名的新选组“局中法度五条”，为幕府方战斗到最后一刻，所以在维新后，土方岁三也成为了拥有武士道精神的末代武士的代表人物。
山南敬助：近藤勇的左膀右臂，试卫馆一派的骨干，剑术高强但是性格沉默寡言。信奉尊攘学说，其信念和新选组的佐幕思想有着根本的差别，后来脱队，因触犯局中法度五条，被处切腹惩罚。
伊东甲子太郎：文武全才，很早便获得了神道无念流、北辰一刀流的免许皆传，而且文学造诣极高，通过藤堂平助介绍进入新选组，担任组内的参谋和文学师范。后因为自己是尊攘派退出新选组，成立了御陵卫士组。最后在油小路附近被新选组暗杀。
冲田总司：新选组第一小队队长，是组内的剑术第一的头号战将。性格天真随和，但肺部有病，传闻中是皮肤白皙的美少年。死于肺结核，享年26岁。
永仓新八：新选组第二小队队长，师从神道无念流，在池田屋事件中一战成名。性格耿直固执，不知变通，但为人重义，反对严苛法度。在甲阳镇抚队失败后退出新选组，和原田左之助加入了精兵队，继续对抗新政府军。在会津战争后，永仓新八得到了赦免，并作为原新选组的成员活到了大正年间。
斋藤一：新选组第三小队队长，无门无派，身份扑朔迷离。几乎参加了新选组的所有战役，并起到了决定性的作用，曾受近藤勇之命卧底御陵卫士组，后在会津战争中代替受伤的土方指挥新选组。明治维新后，斋藤一改名藤田五郎，成为警视局一名警察，一直活到大正四年（1915年），享年71岁，也是新选组骨干中活得最久的一位。
武田观柳斋：新选组第五小队的队长，不仅剑术高强，还精通甲州学兵法，担任组里的文学，兵法师范，喜好男风。后来在投奔伊东甲子太郎带领的御陵卫士组的路上，被斋藤一斩杀。
井上源三郎：新选组第六小队队长，初期试卫馆一派的核心，为人稳重，可靠，人缘极好，威望高。在富之森之战中中弹身亡。
藤堂平助：新选组第八小队队长，和伊东甲子太郎是北辰一刀流的同门。新选组早期核心成员之一，活跃于池田屋事件中。后跟随伊东甲子太郎创办御陵卫士组，在油小路事件中被新选组斩杀。
原田左之助：新选组第十小队队长，师从种田流枪术，使一把长枪，武艺高强。为人粗鲁、豪放，喜欢无拘无束的生活，和永仓新八是好兄弟。最后在上野战争中战死。
山崎烝：新选组役兼监察，和岛田魁一起负责情报工作，并在池田屋事件中起到关键性作用。性格温顺，在组内人缘极好。后在富之森之战中重伤，不久身亡。
岛田魁：新选组内监察，负责情报工作，组内数一数二的巨汉，喜好相扑。土方死后看到了日本的新时代，晚年精神富足，与1900年病逝，享年73岁。
大石锹次郎：幕末著名人斩之一，在新选组中和冲田总司并列的头号杀手，因参与暗杀伊东甲子太郎，在明治三年被政府方处斩。
佐佐木只三郎：京都见回组首领，擅长暗杀，曾参与清河八郎、坂本龙马等多名尊攘志士的刺杀。后来京都见回组被改变为新游击队，佐佐木只三郎在富之森之战中战死。
芹泽鸭：新选举第一任局长，水户藩浪士，信奉尊攘学说，剑术高强，很早便获得了神道无念流的免许皆传。脾气暴躁、蛮横、做事不计后果。因与松平容保佐幕的理念不和，被近藤一派暗杀。
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第一部：幕末风云
在这个动荡的时代里，以近藤勇为首的试卫馆一派正式的站到了历史的舞台上。他们是近藤勇、土方岁三、山南敬助、冲田总司、井上源三郎、永仓新八、斋藤一、藤堂平助以及原田左之助。这九个人命运将一直贯穿着新选组的始末，用鲜血书写着自己的青春。
1. 清河八郎和浪士组
清河八郎，原名斋藤正明，倒幕派人士，曾创办倒幕组织“虎尾会”，后被幕府镇压。文久三年（1863年）二月，将军德川家茂决心去京都拜见孝明天皇，商讨公武合体（天皇和幕府一起统治日本）与攘夷大业。就在这时，幕府建议大赦入狱的尊攘浪人，吸纳他们进入由幕府组织的浪士组，来融掉他们，使其为幕府所用，得知此事的清河八郎，自告奋勇带头组建，成功招募到234人，清河八郎的浪士组即为新选组前身。
2. 芹泽鸭（新选组第一任局长）出场
清河八郎的浪士组共分七队，其中三小队规模最大，有两个头目，为芹泽鸭和新见锦.
浪士组三小队名单：
头目芹泽鸭，属下近藤勇、山南敬助、土方岁三、永仓新八、冲田总司、原田左之助、藤堂平助、平山五郎、野口健司、平间重助等。
头目新见锦，属下阿比类锐三郎、井上源三郎、冲天林太郎等。
可以看出日后新选组芹泽派和近藤派的主力都在其中了。当时按照剑术门派划分山头的现象很常见，芹泽鸭、新见锦、平山五郎等因为都是神道无念流的同门聚 集到了一起，但是当时最不起眼的试卫馆一派（天然理心流）却是队里实力最强的，足足有9个人之多。
3. 试卫馆一派
天然理心流，由远江国人近藤内藏之助开创，该派所学相当驳杂，并走的是乡村路线，多次下乡收徒，一下子就繁盛起来，近藤勇就是天然理心流的第四代掌门人。在清河八郎招募浪士组时，近藤勇带着八名同伴参与其中。分别是同门土方岁三、山南敬助、井上源三郎和冲田总司（近藤派的绝对核心），还有试卫馆的食客（非正式弟子）永仓新八、藤堂平助、原田左之助和斋藤一（近藤派次核心）。因为近藤勇，土方岁三虽然是剑士，但却都是农民身份，在江户时代严格的身份统制下，他们只能以参与浪士组这样的手段，来换取地位的晋升。
3. 壬生浪士组
因为浪士组的首领清河八郎，原本就是尊攘派的志士，而在当时发生了萨摩藩士杀伤英国商人的“生麦事件”，英国对幕府频频施压，趁这个机会清河八郎顺利成章的把浪士组转变为攘夷武装，带领浪士组去横滨抵抗英国侵略军。但是一共有24人没有离开京都，选择留下，这其中既有芹泽鸭，又有近藤勇，也就是日后的新选组，当时称为“壬生浪士组”，投靠了京都守护役松平容保。
壬生浪士组接到的第一个任务就是暗杀清河八郎，因为幕府不能容忍清河八郎把他的浪士组变成尊攘武装。壬生浪士组的第一次暗杀任务因为清河八郎的守卫拼死战斗而失败了。不久之后，清河八郎死于京都见回组的另一起暗杀，凶手是佐佐木只三郎（这家伙参与了之后的许多著名暗杀）和高久半之助。
4. 新选组诞生
壬生浪士组虽然是一群实力不凡的剑士，但归根结底只是一群不守规矩的浪人，向商人收保护费，斩杀力士，强抢民女（主要是芹泽鸭干的）都给他们的声誉抹了黑。这时近藤勇和土方岁三开始担心，松平容保手下不但有一两千会津精兵，还管辖着正规警察组织“京都见回组”，像浪士组这种散兵随时会被取缔，那也就代表着近藤勇他们的梦想破灭。正在这时，发生了日本历史上著名的“八一八政变”，幕府把京都里的长州藩士彻底赶了出去。在这场政变中，浪士组负责守卫蛤门，虽然他们和会津守兵发生了摩擦，但芹泽鸭和近藤勇的冷静果敢传到了天皇耳朵里。事后天皇召见浪士组，正式赐名“新选组”。
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第二部：壬生狼
新选组成立后，马上就进行着一次又一次的肃清活动，因为擅于使用群狼战术（武士道崇尚一对一，但新选组为了以最小的代价换取最大的胜利，经常是多人围攻对方一人），新选组又被成为“壬生狼”。再加上新选组队长以上个个都是剑术高手，尊攘浪人听到是闻风丧胆。而池田屋事件更是让新选组名闻天下。
5. 肃清芹泽鸭
新选组成立后，组内继续维持着双头制，芹泽鸭和近藤勇为共治的总长。但是芹泽鸭也仅仅做了新选组一个月的局长。
芹泽鸭虽然剑术超群，师承神道无念流，并且很早就得到了免许皆传资格，但是他的本质还是一个流氓无赖，脾气暴躁，不受控制，做事嚣张不计后果，这些都让近藤勇和土方有了要肃清他的理由。因为近藤勇和土方岁三的梦想，是让新选组能够发展壮大，并且最终成为幕臣，改变自己的平民身份，而芹泽鸭的胡作非为阻碍了他们的路。但还有最关键的一点，芹泽鸭是出自水户藩的浪人，深受尊攘思想的影响，和以佐幕为理念的新选组格格不入。因此连新选组的顶头上司，松平容保都下达了要秘密处决芹泽鸭的命令，这也是新选组内部最大的一次暗杀。
为了能够顺利暗杀芹泽鸭，近藤勇先是以触犯局中法度为理由，处决了芹泽鸭的左右手，佐伯又三郎和新见锦，直到此时，芹泽鸭还没有意识到危险的来临。
日，在八木家寄宿的芹泽鸭与平山、平间等人，全被近藤勇邀请赴宴去了，当天晚上10点，芹泽鸭喝的酩酊大醉，被近藤勇叫了一个驾笼抬回了八木家，行完礼近藤等人便返回了旧前川邸。大约一个时辰后，五名蒙面男子持剑冲入了八木家，如入无人之境，分别是近藤勇，土方岁三，山南敬助，冲田总司和原田左之助。芹泽鸭虽然烂醉如泥，但毕竟是神道无念流高手，有着剑士的本能反应，一上来就砍伤了冲田总司，随后冲上来的山南敬助犹豫了一下没有及时出手，给了芹泽鸭逃跑的机会。就在鸭快要逃出去的时候，他听到自己的小妾阿梅临死前的一声惨叫，心慌了一下，恰好踩在了冲田总司碰翻的凳子上，踉跄了几步，被随后赶上的原田左之助，土方岁三结束了生命。
这次暗杀中，芹泽鸭，平间五郎当场被杀，平间重助逃脱。
6. 池田屋事件
1864年，在芹泽一派被肃清后，新选组也迎来了很多新生力量，其中的代表人物就是武田观柳斋和山崎烝。
武田观柳斋是出云母里藩藩士之子，年轻时是名医学生，后来脱藩（意思就是离开自己所住的藩，以前的日本人脱藩就是大罪，所以大部分人一辈子都没有离开过自己所住的藩）流浪在外，修习甲州流军学（武田信玄的战术兵法），在加入新选组后，因为拥有过人的智谋和出色的口才，受到近藤勇的重用，担任新选组队员军事训练的教官。
山崎烝出身摄津大阪，加入新选组后与岛田魁、林信太郎一起担任诸士调役监察，他不但熟悉京都和大阪的人文地理，还与许多大阪豪商结交，很快成为新选组内不可或缺的重量级人物。性格外貌上，山崎烝身材高大，是个性格温顺的美男子，深受新选组上下的尊敬和信任。
由于新选组规模和实力的增强，近藤勇非常渴望类似八一八政变那样的建功机会再次来到，好在风头上压过一起维持京都治安的“京都见回组”（组员出身高贵，装备精良，是松平容保手中一张王牌），池田屋事件给了新选组一次大出风头的机会。
从山崎烝和岛田魁探到的情报，6月5日晚，大批尊攘派浪人将在池田屋或四国屋聚会，近藤勇打算兵分两路，一队由他自己率领9名队员，延四条桥前进，目标池田屋；另一队由土方岁三带领，共24人，取道三条桥，目标四国屋。
按照近藤勇原本的想法，池田屋位于长州藩邸旁边，又是该藩尊攘派经常聚会的地方，敌人不该如此大胆在这里聚会，便把主力部队派给了土方岁三，而自己这一队，主要人物是往池田屋方向搜索，截断四国屋浪人的退路。等到了池田屋才发现，在池田屋的浪人有二三十人。
在苦等半个时辰援兵还没有来，近藤勇不愿放过机会，立即下令强攻池田屋，带领冲田总司、永仓新八、藤堂平助正面突入，武田观柳斋等其他人守住所有门。进入池田屋后，所有浪人几乎都在二楼，近藤勇留下永仓新八和藤堂平助，带着冲田总司冲上二楼。冲田总司是新选组中天才剑士，绝招是“平正眼”（冲田的独门绝技，能将长剑瞬间连刺三回），很快斩杀了多名浪人，震慑于冲田总司的杀气，不少浪人惊慌失措的跳到一楼，试图从中庭逃跑。近藤勇眼看主战场转移到了一楼，只留下冲田总司一人在二楼牵制，自己也冲到一楼。
在二楼的冲田总司一人对战五人，完全占据主动，不但同时躲过了五个方向的斩击，还反手刺死了一人。但是就在这个关键时刻，冲田的肺病发作了，一阵剧烈的咳嗽，倒在了地板上，那四名浪人头都不敢回直接跑掉。一楼混战中藤堂平助额头眉间中刀，退出战线；永仓新八手指被砍断，爱刀折断，但还和近藤勇一起死命守护大门。往外冲的一共有十来人，他们发疯的向外突击，因为出去向北三百米，就是长州藩藩邸，进去了就有法外治权，幕府警察无权搜查。在这千钧一发的时候，土方队从四国屋赶来，彻底瓦解了浪人的意志，池田屋大胜。
池田屋事件中，23人被捕，以吉田稔磨为首的7人被斩杀。当时准备参加密会的桂小五郎，在得知新选组突袭了池田屋后，便不顾吉田稔磨的求援，转身便逃，躲入了对马藩邸中闭门不出，后被新选组取了个外号叫“长腿小五郎。”不过桂小五郎却不以为耻，还在数年后写道：“因当时考虑到维新的前途问题，所以才没有答应吉田的求援请求，并非出于畏惧心理”
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第三部：幕长战争开始
因为池田屋事件而闻名天下的新选组开始积极扩张，武田观柳斋、山崎烝和伊东甲子太郎的入队，使得新选组走入了鼎盛时期，但这时近藤勇却没有察觉，分裂的苗头已经慢慢开始显现。与此同时下关战争和萨英战争，让原本坚持攘夷的长州藩和萨摩藩，转变成了开国派，长州藩和幕府的仇恨与日俱增，江户幕府的第二次长州征伐（幕长战争）一触即发。
7. 蛤御门之战---第一次长州征伐
日，长州藩正式举旗，决定武力上洛（攻入京都），并提出三项诉求：重新确定攘夷为基本国策；安抚在京的尊攘派浪人；处置袭击池田屋的暴徒（新选组）。
这次战争虽然新选组不是主角，但是它对整个历史有着重大的意义，是长州藩第一次对幕府军的大型战争。虽然以长州藩的两千兵力对阵幕府领导的两万多人结局是必败无疑，但是这次战争加深了长州藩对幕府、以及松平容保的仇恨，也使长州藩成为日后倒幕军的主力之一。在蛤御门之战中，长州藩的久坂玄瑞、来岛又兵卫战死（被萨摩藩的神射手川路利良击毙），真木和泉自杀切腹，长州藩的尊攘派几乎全军覆没。
8. 永仓新八的造反
蛤御门之战后，朝廷和幕府一共颁发了1100两赏金，近藤勇和土方感激涕零，为了使新选组得到进一步的认可，近藤勇决定对组内实行纪律的强化，在局中法度五条之外，又让土方岁三起草了“军中法度”，目的是让新选组能成为独当一面的军队，军中法度的公布，直接造成了永仓新八等干部的造反。
1864年8月，永仓新八、斋藤一、原田左之助、尾关雅二郎、岛田魁、葛山武八郎六名队员私自上书松平容保，列举了近藤勇的五项罪名，要求撤销近藤勇的局长职务，否则六人集体脱队。永仓新八等人深知近藤勇的脾气，在上书之时就做好了切腹的准备，果然近藤勇知道后勃然大怒，后来在土方岁三的劝说下，为了保存实力，只对永仓新八和斋藤一等人实施了禁闭的处分。
其实这次造反，关键还在于理念的不同，像永仓新八这样的浪人，最大的希望就是像自由的鸟儿一样，无拘无束，不用理会什么尊攘倒幕的思想，大碗喝酒大块吃肉的绿林生活才是最合他胃口的。但是现在近藤勇和土方希望把新选组变成佐幕的军队，实现自己的梦想，组内法度和军中法度的出现直接导致了冲突的爆发。这次的事件也是新选组未来内部巨大内讧的预告。
9. 参谋：伊东甲子太郎
为了壮大新选组，近藤勇决定去江户招募新队员。这次江户之行非常成功，为组内带来了很多精兵强将，其中就有“幕末四大人斩”之一的大石锹次郎（幕末四大人斩说法不一，但具体应该包括五个人，肥后藩的河上彦斋，此人是浪客剑心的原型；萨摩藩的中村半次郎；土佐藩的冈田以藏；萨摩藩的田中新兵卫；新选组的大石锹次郎），在阿部十郎大正年间所著《史谈会速记录》中，大石锹次郎是和冲田总司并列的新选组头号杀手。
不过近藤勇在江户最大的收获，还是得到了剑术谋略俱佳的全才，伊东甲子太郎。
伊东甲子太郎师从神道无念流，是芹泽鸭的同门，也是尊攘学说的信徒，后又进入北辰一刀流的道场学艺。然后经由同为北辰一刀流门徒的藤堂平助介绍，认识了近藤勇。虽然伊东甲子太郎是与会津藩理念不同的尊攘派，也不是天然理心流出身，但他流利的口才，秀丽的容姿和出众的韬略，获得近藤勇极大的好感，近藤勇和伊东秉烛夜谈后，当即邀请他加入新选组，担任新选组的首席参谋和文学师范。
伊东甲子太郎的加入，代表着新选组的最鼎盛时期，组员达到了空前的300多人；但同时，他的加入也预示着新选组由盛到衰转折的开始，之后的新选组迎来了一次又一次的危机。
10. 山南敬助切腹
自从暗杀芹泽鸭时，近藤勇就对出手犹豫的山南敬助有些不满，但是因为山南是新选组的元老，又是天然理心流的同门，近藤勇对他始终还是保持着敬重的态度。
山南敬助年轻时就获得了小野一刀流的免许皆传，后又拜入北辰一刀流门下，他在游学江户时，来到了天然理心流试卫馆**，心血来潮要踢馆。败在了近藤勇手下的山南敬助转而加入了天然理心流，与冲田总司一起担任试卫馆的剑术教头。但一切都随着土方的出现而改变，山南沉默寡言，不善言辞，比不上土方岁三的能言善辩。新加入的土方岁三，慢慢取代了山南原来的位置，与近藤勇形影不离，受到冷落的山南敬助久而久之对土方岁三产生了一丝嫉恨。
但是山南敬助与其他人最大的不同，还是他和芹泽鸭一样，是个尊攘派人士，所以当伊东甲子太郎来到新选组时，山南和伊东交谈了好几天，两个人同是北辰一刀流的同门，而且也同样信奉尊攘学说，大有相见恨晚的感觉。不过这种情况，引起了近藤和土方的不安，害怕山南变成第二个芹泽鸭。不久后，山南敬助被隔离起来，这也使得悲愤的山南，萌发了退出新选组的念头。
在之后组内的移屯会议上，山南敬助和土方大吵了起来，会议气氛尴尬，不欢而散。就在日，新选组副长山南敬助出走，留给了近藤勇一封信，信中称土方岁三为谄媚小人。第二天，近藤勇给冲田总司下了命令，找到山南，若他不肯自行了断，可以就地处决，连一向杀人不眨眼的冲田在接到这样的命令时，内心也在痛苦着。
山南很快就被发现了，他根本就没有要逃跑的意思，跟着冲田总司回到了组里，接受了私自脱队要切腹的处罚。切腹前一天，永仓新八和伊东甲子太郎找到了山南敬助，哭着问他为什么还要回来？并要他再次逃跑。但是山南笑着说：“已经逃了一次，向近藤局长表明自己的愤怒就可以了，现在已经做好了切腹的准备”切腹当天，冲田总司自愿担任了山南的介错人（切腹后为避免长时间痛苦，快速砍头的人），看着山南的遗体，土方也留下了复杂的泪水。
11. 长州藩的再起、第二次长州征伐
第一次长州征伐后，长州藩的尊攘派元气大伤，俗论派（亲幕府派）掌握长州藩，又恰逢下关战争（长州藩为表示攘夷决心，私下和英国等列强开战，结果全军覆没），海防被四国联合舰队全部摧毁，这时长州奇兵队创始人高杉晋作临危受命，担任起和列强谈判的重任。在和列强成功议和后，高杉晋作、伊藤博文和石川小五郎率领着84人的队伍齐集功山寺起事，史称“功山寺举兵”，这次起义高杉晋作大获全胜，也代表着尊攘派再次掌握长州藩。
在下关战争的失败中，高杉认清了自己国家和西方列强之间的差距，长州藩从攘夷转变成了积极开国，同时桂小五郎向高杉晋作推荐了一名懂得兰学（从荷兰传入的西方文明）和西方军学的军事奇才，大村益次郎。在桂小五郎和高杉的支持下，长州藩开始购买新式装备，训练枪炮民兵，为以后的战争做准备。
因为高杉晋作的功山寺举兵，让幕府非常不安，一桥庆喜和松平容保向将军德川家茂，不如趁这个机会彻底毁灭长州藩。德川家茂采纳了这个进言，动员诸藩组织征讨军。但是军队的组织异常的不顺，参与征讨的只有几个德川家的谱代大名（关原合战前跟随德川家康的大名），外样雄藩（关原合战后投降德川家的大名）几乎都作壁上观，按兵不动，征讨军的部队少得可怜，这说明幕府的权威已经开始衰落。
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第四部：明治维新的转折
由于坂本龙马的斡旋，长州和萨摩这两个一向敌对的雄藩结成了同盟，倒幕力量大增。而十四代将军德川家茂和孝明天皇的突然离世也代表着幕府与天皇共同统治的设想已不可能再实现，朝廷中的倒幕势力开始抬头。而坂本龙马的船中八策、大政奉还，也使得日本政权和平交替正在一步步的慢慢实现，直到近江屋事件的发生。而此时的新选组发生了自成立以来的最大内讧。
12. 维新的转折---萨长同盟
自幕末初始，长州和萨摩藩就一直不对付，长州属激进的尊攘派，而萨摩是铁杆的公武合体派（天皇和幕府联合）。八一八政变和蛤御门之战，萨摩藩都对打败长州藩起了决定性的作用，两个雄藩的关系已经水火不容，他们之所以能够联手，有一个人起了关键性的作用，坂本龙马。
坂本龙马本是土佐藩士，脱藩后组织了陆援队和海援队，通过秘密贸易，大力支持萨摩的西乡隆盛（西乡吉之助）。蛤御门之战后，坂本龙马和中冈慎太郎认识到，雄藩才是日本维新的希望，若雄藩间不断内讧，只会让幕府渔翁得利。因此坂本龙马呼吁雄藩间互相合作，利用他的强大人脉斡旋于长州和萨摩之间，在第一次会谈失败后（西乡隆盛中途改变主意爽约），坂本龙马继续周旋，终于在日，萨摩藩的西乡隆盛、小松清廉、大久保利通，与长州藩的代表桂小五郎，签订了六条“萨长密约”，其中包括发生长州战争时，萨摩藩要全力帮助长州。
萨长同盟的建立，改变了第二次长州征伐，长州藩没有了后顾之忧，又通过萨摩藩从大英帝国买来了上千支最新式的恩菲尔德速射步枪，而幕府军还在穿着老旧的武士铠甲，使用老式的滑膛火枪，结果在小濑川被长州民兵打得一败涂地。幕府的海军也遭到高杉晋作的奇袭，或被摧毁，或被俘虏。
不久，因为战争拖延过长，征讨军各藩物价飞涨，百姓生活困苦。就在7月20日，德川家茂在大阪城得了急病，不幸去世。失去主帅的征讨军完全丧失了斗志，江户幕府的权威也丧失殆尽，第二次长州征伐以幕府的失败告终。
13. 内讧前兆---伊东甲子太郎脱队
日，一桥庆喜接过了朝廷的敕书，就任幕府第十五代将军，改名德川庆喜。就任将军的庆喜，一改之前的攘夷作风，积极和英法等国合作，建立了钢铁厂和造船厂，要和长州学习，让幕府带领日本走向现代化。
就在德川庆喜踌躇满志时，12月25日京都传来孝明天皇驾崩的消息。德川家茂和孝明天皇的死去，代表着日本一个时代的结束，也代表着松平容保等人希望出现的公武合体的纽带已不复存在。幕府和萨摩长州等雄藩和平共处已经不可能了，战争一触即发。
就在这时，新选组的伊东甲子太郎，对新选组未来的走向和近藤、土方形成了无法逾越的隔阂。其实伊东和芹泽鸭、山南敬助一样，信奉水户尊攘学。当时伊东通过藤堂平助被介绍给近藤勇时，近藤勇因为爱惜伊东甲子太郎的文采智略，才摒弃了政见的不同。但随着山南敬助的惨死，以及幕府第二次长州征伐的失败，伊东和近藤理念的冲突越来越激烈。近藤和土方要新选组继续忠于会津和幕府，而伊东甲子太郎则希望新选组放弃幕府，成为天下尊攘活动的先锋。
近藤和土方此时明白了，伊东其实就是第二个清河八郎，他是要整个改变新选组的颜色。只不过伊东不是孤身进组的，跟随他进组的有他的弟弟、师兄弟等6人，都是他的有力后盾。此外，由于伊东的影响力和出色的口才，藤堂平助、永仓新八、斋藤一等原先对近藤不满的队员，也渐渐**在伊东身边。这时的伊东甲子太郎，已经让近藤勇无可奈何了。
伊东甲子太郎离开新选组的方式，选择的非常巧妙，他派人拜见了幕府的山陵奉行（负责保护历代天皇寝陵）户田大和守忠致。提出了伊东等十余名新选组成员，希望能脱离近藤的管制，前往安葬孝明天皇的东山陵，负责陵寝的保护工作，以伊东为首脱离出来的这些组员，就称为“御陵卫士组”。伊东甲子太郎的这一招绝对高明，一方面，伊东等人在工作关系上隶属于幕府的山陵奉行，还是为幕府办事，让近藤和土方不能为难他；另一方面，伊东保护的是孝明天皇的陵寝，又符合尊攘派的道义，完全可以另立组织，把新选组里的异见者吸引过来，达到弱化新选组的目的。
就这样，在进行了一场和谐的送别酒宴之后，伊东甲子太郎一行15人，离开了新选组，这其中除了伊东的心腹外，还有藤堂平助、桥本皆助、新井忠雄、斋藤一这些新选组老骨干干部。
14. 武田观柳斋之死
不久以后，在会津藩松平容保的主持下，新选组终于得偿所愿，全体成为正式的幕臣身份，这标志着新选组不再是一群浪人，而是幕府统领的武士，享受于京都见回组对等的资格，这正是近藤和土方一辈子梦寐以求的，从此以后，新选组算是正式和会津以及幕府绑在了一起。
就在御陵卫士组一个月不到的时间，新选组就发生了两次组员私自脱队的情况。先是田中寅三，而第二次竟是多达茨木司、富川十郎等十人之多。情报证实，这些人在脱队前都和伊东甲子太郎有过接触，近藤勇怒不可遏。但为了保存实力，近藤勇还是带上土方岁三苦苦劝他们回心转意，结果劝了整整两天，不但没有效果，茨木司等四人跑到旁边的屋子，二话不说就切腹了。近藤勇彻底被激怒了，看来不对伊东下手不行了。
谁知道下一个被伊东影响的，竟然是第五小队队长和新选组文学、兵法师范的武田观柳斋。因为武田观柳斋师承的是甲州流兵法，在新选组早期，武田那可是组内数的着的实权人物，当初永仓新八上书松平容保的事，也是武田观柳斋运用口才，摆平了这件事，所以深得近藤和土方的信赖。然而随着时代的进步，像甲州流这样的军学，越来越显得古板落后（主要是排阵，长蛇阵、八卦阵等），又赶上德川庆喜当上将军后，要求幕府军队采用法式西洋操练法，因此武田观柳斋日益感到自己在新选组里的没落。
随后武田观柳斋产生了跳槽御陵卫士组的想法，伊东甲子太郎这样的尊攘派，应该不会用外国人的战法的，所以他的甲州流军学肯定还有用。就这样，武田开始明目张胆的和伊东通信，完全不把近藤勇放在眼里。但是武田观柳斋在组里的人缘极差，还喜欢搞男风（喜欢男子），很快就有人把这件事告诉了近藤勇，为了杜绝再出现这样的脱队事件，近藤勇想出了一个一箭双雕的暗杀计划。
6月22日，近藤勇给武田观柳斋开欢送会，新选组的主要干部济济一堂。武田观柳斋自视甚高，心想近藤勇是绝对不敢对他下手的。喝的酩酊大醉后，武田观柳斋带着同伙枚方，醉醺醺的上路了。行进到鸭船的钱取桥时，有一名戴着斗笠的人，站在桥的中间，武田使劲压住了酒劲，走上前去：“哎呀，这不是卫士组的斋藤一大人吗？是不是伊东让你来迎接......”武田话音未落，斋藤一突然抬起头，抽出刀猛刺过来，武田观柳斋根本躲避不及，死在地上。
“卫士组岂会岂会接纳不忠之人？你回去告诉其他人，就说我斋藤一受伊东大人的命令，已将逆徒观柳斋处决了！”斋藤一收刀入鞘，冷冷对随行的枚方说道。很快武田观柳斋被处决的消息传遍了新选组，很多原本因观柳斋离去，蠢蠢欲动的组员都死了心，看来卫士组这条路已经断了。
这是最高兴的要数近藤勇，原来斋藤一这个神秘剑客一直无门无派，所以伊东和藤堂在脱队时，才会对他极力拉拢。没想到近藤勇更加棋高一着，斋藤一就是近藤勇打入卫士组的一张王牌。
15. 坂本龙马的船中八策
日，日本的大政局走到了关键的十字路口上。这一天，在一艘自长崎开往兵库港的轮船上，一份奠定日本维新格局的纲领，在坂本龙马笔下诞生，史称“船中八策”（具体内容不写了）。可以说，之后的明治维新，就是在坂本龙马的这八策的指导下进行的。
不久后萨摩藩在西乡隆盛、大久保利通等人的游说下，决定走武力倒幕的道路，得到消息的幕府人员山内容堂惊慌不已，派人向坂本龙马问策，龙马的回答是，可以把他的“船中八策”的第一条拿出来用一下，就是“大政奉还”。如果德川庆喜把大政奉还给了天皇，那再打幕府就是师出无名了。山内容堂非常兴奋，一时间公武合体的运动又占据了上风。
就在坂本龙马进京后的十月十八日，他亲自前往高台寺，会见了伊东甲子太郎。伊东非常仰慕坂本龙马的才华，虽然伊东本人是尊攘派，但相比萨摩和长州，他更赞成坂本龙马这样的温和革新政策。同时，伊东也提醒龙马要注意自身安全的警备。因为就在1866年一月，留宿在京都寺田屋的坂本龙马就遭到了幕府伏见奉行百余人的袭击，当时龙马的恋人“梄崎龙”正在一楼洗澡，见到窗外幕府部队杀了过来，慌乱之下居然光着身子冲上二楼，向龙马报告了险情。等幕府奉行冲进来时，龙马先用手枪射击，然后逃到了伏见的萨摩藩邸，才逃过了一劫。
但是坂本龙马没有想到的是，最终他还是没有看到自己亲手缔造的这个新日本。
16. 龙之陨落---近江屋事件
日，这一天是坂本龙马33岁的生日，那天他的兴致很高，恰逢他的战友中冈慎太郎来和他谈事，便极力留下他吃饭。之前坂本龙马一直住在近江屋的仓库中，因为四周都是土墙，便于防御，但是龙马前几天得了重感冒，好心的屋主夫妇就把他转移到了通风好的二楼居住。不一会儿，有几名自称是十津川乡士的男子来到近江屋，要找龙马商议大事。因为十津川乡士大多是尊攘派，一向和土佐、萨摩同气连枝，所以龙马的仆人藤吉也没有多想，直接把他们迎了进来。谁知这些人一进屋就拔出刀剑，冲上二楼。藤吉立刻大叫起来，坂本龙马听见藤吉喧哗，下意识的向他喊到不要吵到客人。结果就是龙马不经意的这句话，使刺客辨明了他的方位。
坂本龙马先是额头被砍了一刀，后来后脑又被补了一刀，当场身亡。藤吉伤重不治，次日身亡，中冈慎太郎比藤吉多挨了一天。因为中冈在死前还有意识，所以留下了一些龙马遇害时的证据。不过这些证据也非常的单薄，使得坂本龙马遇刺事件在历史上充满了谜团，成为日本历史上最大的黑幕事件之一。
17. 坂本龙马之死的黑幕
坂本龙马的死充满了不可思议的因素，人们对此的大部分认知，来自于中冈慎太郎死前的话，以及目击者的证言。
在当时，最先受到怀疑的是新选组，先是伊东甲子太郎在现场发现的刀鞘，愿意凶手是原田左之助，后来又从龙马和中冈身上的伤口，判断凶手是“左撇子”斋藤一（但斋藤其实并非左撇子），但这些论断全是伊东的猜想，做不得证据。进入明治时代以后，受到最大怀疑的是新选组的著名人斩者大石锹次郎。
1868年12月，大石锹次郎遭到新政府的诱捕，新政府对大石的拷问异常严厉，还逼迫大石承认参与了暗杀龙马的行动。最后熬不住的大石，只得承认近江屋暗杀全是自己所为，充当了新政府舆论造势的牺牲品。
1870年，在箱馆战争中取胜的政府军，在俘虏中认出一名叫今井信郎的原京都见回组队员。根据今井信郎的供词，原来是见回组接到了头目佐佐木只三郎的命令，以今井信郎、渡边吉太郎、高桥安次郎等6人组成了暗杀小组，杀害了坂本龙马和中冈慎太郎，坂本龙马之死终于真相大白。但是直接参与刺杀的今井信郎只是被处以禁锢刑，后来被静冈藩引渡，晚年还每年参加坂本龙马的慰魂法事，忏悔自己的罪孽。
日本史学界的权威说法，就是京都见回组才是杀害坂本龙马的真正凶手。但是龙马之死依然存在着很多疑点：佐佐木只三郎上面的指使者是谁？因为见回组没有杀害龙马的充足理由，坂本龙马提出的大政奉还，正是挽救幕府的良策，而佐幕派的见回组也没到杀人不分青红皂白的地步。
第一个被怀疑的是萨摩藩，因为凭借坂本龙马的威望，迟早会取代萨摩藩的位置，成为日本维新的头号功臣。原本坂本龙马和中冈慎太郎组织的陆援队和海援队，目的是支持萨摩的尊攘运动，但船中八策后，龙马已经回到了土佐藩，并将大批军火改运到土佐藩，大大增强了土佐藩的实力。
其实被怀疑的就是土佐藩的佐藤象二郎。土佐勤王党被镇压后，佐藤象二郎担当了山内容堂的参政，掌握着藩内的实权。而这时的坂本龙马，又是船中八策，又是回归土佐，早晚会超过他的地位，害怕失势的后藤，指使刺客杀了龙马。否则土佐藩邸只离近江屋一街之隔，为什么龙马和中冈遇刺时，没有得到土佐藩的任何支援？
另外还有些其他的说法，比如说刺客其实是来刺杀中冈的，龙马不过是受了牵连，因为中冈身受刀伤数十处，明显火力集中在他身上；也有的说幕后黑手是英国领事馆，因为英国人看到龙马的船中八策，害怕日本会就此崛起，所以害死了他；还有的说幕后其实就是伊东甲子太郎，他把坂本龙马杀害，并借机嫁祸给新选组，挑起陆援队、海援队和新选组的斗争，自己趁机壮大卫士组的实力。但是这些说法都没有直接有力的证据，事情的真相已经永远消失在历史的迷雾中了。
18. 油小路的绝杀
日，高台寺的伊东甲子太郎收到了近藤勇的邀请函，说已在深雪太夫家里摆下宴席，邀请伊东面谈国事。关于新选组要对伊东不利的传闻此时已经是人人皆知，伊东的心腹都劝他此行凶多吉少，千万不要去。但是伊东淡然一笑，说他入京都原本就是为了尊攘大业，早已看破生死，如果此行能侥幸说服近藤，拉拢新选组可说是大功一件，假如带着护卫前去，只会让对方笑话卫士组胆怯。
傍晚时分，伊东甲子太郎孤身一人来到近藤勇的小妾家中，与近藤勇把酒言欢，两人都说了不少冰释前嫌的话，伊东为近江屋事件怀疑新选组表示了歉意，近藤勇也热烈的与伊东商谈着大政奉还的前景。但是这个时候，伊东却不知道，卫士组的卧底斋藤一，早已经返回新选组屯所，把伊东的行进路线、和卫士组的底细告诉了土方岁三。土方立即派出了大石锹次郎为首的四名精英，埋伏在伊东返回高台寺的必经之路。
晚八时后，喝的醉醺醺的伊东告辞了近藤，开始朝高台寺方向走去。当他走到油小路的木津屋桥时，埋伏好的大石锹次郎突然冲出，将长枪深深的刺入了伊东的肩膀，枪尖直贯伊东的喉咙而出。当时伊东暴睁双眼大喊了一声“奸贼”，居然还能拔出刀来，先将大石的长枪砍断，又斩杀了一名新选组队员。就在大石等人目瞪口呆时，伊东甲子太郎疯狂的朝油小路方向跑去，等到大石等人追赶上来，才发现伊东已经倒在了本光寺的前面，一副死不瞑目的模样，手里还紧紧攥着他交给天皇的建白书。
就在伊东离开之后，铃木、加纳等人坐立不安，生怕伊东出了什么事，大概在凌晨的时候，一名乔装改扮的新选组队员跑来高台寺，告诉铃木，伊东先生在油小路那里，和一名土佐藩士发生口角，被对方砍伤了左足，正在油小路坐着。于是大家打算一起出去迎接伊东回来，而且大家商定都不要穿着甲胄，就算有埋伏，穿着平常的衣服战死，也不想让后世人笑话他们卫士组胆小。当时斋藤一已经返回了新选组，新井忠雄有事外出，而阿部十郎和内海次郎当天一早就去山里打鸟。所以前去油小路的卫士组队员，只有八人，分别是藤堂平助、铃木三树三郎、加纳鹫雄、服部武雄、桥本皆助、富山弥兵卫、毛内有之助和筱原泰之进。
凌晨时代，藤堂等人来到油小路，发现伊东血肉模糊的尸体，大家都悲愤莫名，正准备将他收敛，突然一声炮响，一个穿黑衣服的剑士突然跳出。朝藤堂平助背后直接砍了一刀。忍痛的藤堂喊了一声：“我们中了新选组的奸计了！”说完，只见四五十名新选组队员举刀围了过来，藤堂平助被数名新选组刀手围住，瞬间死在乱刀之下。
身材高大的服部武雄发起狠来，把双刀舞的和车轮一般，与八九名敌人混战起来。这时，筱原、铃木等人见敌众我寡，也边战边走，准备突围。新选组众人发觉了他们的目的，组成人墙，打算把剩下的几人全部围歼。这时服部武雄越战越勇，将二刀流神髓发挥得淋漓尽致，用高大的身躯护住了同伴的退路，高呼：“记住，卫士组和新选组奸贼势不两立，你们要逃出去为伊东先生了我报仇！”然后服部武雄红着双眼，披散着头发，如恶鬼下凡接连砍杀数名新选组队员，连两把刀都折断了。正在这时，师从“种田流枪术”的原田左之助操着长枪，一下将服部武雄此番，其余人一拥而上才结果了他的性命。
这一站，近藤勇等人成功诱杀了卫士组的三名主力藤堂平助、服部武雄和毛内有之助，御陵卫士组遭到毁灭性的打击。残余的卫士组成员只得躲入了萨摩藩邸寻求庇护，继而加入了倒幕的浪人组织“赤报队”，继续与新选组抗争。
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第五部：幕府和天皇
大政奉还后的德川庆喜依然握着日本的实权，以萨摩、长州为主的倒幕军为了击垮江户幕府，挑起了著名的鸟羽伏见之战。天皇新政府军和旧幕府军的大决战即将开始，但这仅仅是日本长达一年半内战的开端。而新选组虽然肃清了伊东等脱队人员，自己的实力却也遭到了极大的损害，组内剑术第一的冲田总司也将退出前线。
19. 德川庆喜的抗争
日，将军德川庆喜集结了四十藩大名，来到京都的二条城，向明治天皇递交了“大政奉还表”。第二天15岁的明治天皇应允了庆喜的上表，24日德川庆喜又递交了征夷大将军的辞呈，政权的交接正式完成。这样朝廷公卿岩仓具视和萨长同盟就失去了倒幕的借口，但庆喜只是表面上把政权还给了明治天皇，实际的权力还是在庆喜一派的手中，江户幕府依然是许多藩国的领导，并握有数百万石的天领（包括大阪城在内的很大片国土），并占据着重要的都市、矿山。
朝廷也很清楚的看到了这一点，为了解决天皇政府仍无实权的问题，明治天皇亲自驾临学问所，签署并发布了“王政复古大号令”，意思是天皇要仿效古代先君，重新掌握国家权力。摄政、关白、将军这三个妨碍天皇亲政的官职被废除，取而代之的是总裁、议定和参与。新内阁的组建，几乎清除出去了所有的亲幕府派，而天皇新政府已经是倒幕派的天下。接着明治天皇在新政府的支持下做出了让德川庆喜“辞官纳地”的决定。
12月13日，德川庆喜只得返回了大阪，这时，会津藩下达了幕府的命令，取消见回组、新选组的称呼，统一改编成“新游击队”的番号。新选组终于如土方岁三所愿，变成了正式的军队。但是近藤勇却拒绝了使用新游击队的名字，执着的继续使用新选组的称号，打着诚字旗。而新选组的职责，就是继续留在二条城巡逻，名为维护治安，实为安插在天皇御所边的一个钉子。
虽然离开了京都，德川庆喜并没有放弃，他在12月16日接见了英法美俄等列强，行使着独立的外交权，准备和萨长搞长期对峙，伺机反攻京都。而列强则大多冷眼旁观，等着幕府和新政权开战，看谁更强再加以承认。
20. 近藤勇遇刺
12月18日，近藤勇被幕府町奉行永井尚志邀请到二条城，商讨布防事宜。当时的气氛已经非常紧张，近藤勇丝毫不敢大意，戴上了岛田魁等足足二十名队员作为护卫。在近藤勇乘马越过寺町时，被御陵卫士组的阿部十郎发现，当时铃木、筱原这些卫士组残党还都藏匿在萨摩藩邸。阿部见近藤勇防卫森严，没有贸然动手，而是悄悄尾随，仔细观察。一会儿近藤勇商议完事情，从二条城出来了，但是他没有和大部队一起回屯所，而且仅仅带着岛田魁等少数队员，往深雪太夫宅邸去了（近藤勇的小妾）。
一直跟踪的阿部十郎见刺杀的大好时机来了，马上回去通知同伴，为伊东甲子太郎报仇。随后阿部和富山拿着铁炮，筱原和加纳拿着长枪，火速跑到伏见街道弯曲的墨染这个地方，悄悄埋伏了下来。下午四时，近藤勇骑着高头大马，缓缓出现在富山的射程中。只听“轰”的一声铁炮响，马上的近藤像被海浪冲击般，往后仰了仰，衣服碎片四散。可惜富山的准头还是差了些，近藤被击中的只是他的肩膀。此时机警的岛田魁，马上意识到己方被伏击了，他迅捷的抽刀，狠狠的打了近藤的马屁股一下，那马吃痛不过，飞快的往前奔跑。近藤勇虽然受伤，但毕竟是剑术高手，只见他不慌不乱，把身体伏在马背上，使得富山等人无法再次瞄准。冲到墨染拐角处，筱原挺着长枪冲出，谁知近藤的马快，筱原最后功亏一篑，只能看着近藤往伏见方向逃去。卫士组不敢恋战，稍作战斗就有秩序的撤退了。
近藤勇返回营地，接受了紧急治疗，虽然没有生命危险，但肩膀被铁炮的铅丸击中，已成皮肉翻转状，为避免伤口感染，需要进一步治疗。但由于京都局势紧张，有经验的外科医生都已经四散离去，没有办法，近藤勇只能在冲田总司的陪伴下，前往大阪城接受治疗。近藤勇这一走，错过了第二年初幕府和萨长间爆发的鸟羽伏见大决战，算是一个遗憾，自此之后新选组的实际总指挥职务，由副长土方岁三担当。
12月25日，“赤报队”袭击江户城的事件爆发，点燃了鸟羽伏见之战的导火索。
21. 相乐总三的挑衅
大政奉还后，德川庆喜虽然答应了朝廷的要求，即辞官纳地。但庆喜带着大批军队退到大阪后，根本没有交还朝廷领地的意思。所以大久保利通和西乡隆盛极力劝谏新政府，要对大阪用兵。不过这一方案遭到了新政府的反对，因为政府的实权还是被山头林立的雄藩联盟把持着，萨摩和长州只是其中的一个山头而已，所以其他藩还不敢贸然公开倒幕。这时西乡隆盛和大久保利通一合计，想到了著名的池田屋事件，当初松平容保派新选组袭击了池田屋，杀了很多尊攘派志士，挑衅了长州藩打了场损兵折将丧失道义的蛤御门之战，好几年没恢复元气，差点玩完。那么今天新政府何不炮制个萨长版的“池田屋事件”，来激怒幕府进入他们的圈套。这个挑衅的任务，就交到了萨摩藩暗中支持的浪人组织手里。
这个组织就是“赤报队”，首领名叫相乐总三，队员多是尊攘论者，对幕府仇恨极深。随后，赤报队开始和萨摩藩秘密联络，接受了萨摩藩士伊牟田尚平和益满休之助的指导和资助，成长为倒幕的急先锋，因为赤报队的活动范围接近幕府的老巢江户城，所以他们便是担当挑衅任务的最佳人选。
相乐总三对赤报队下令，潜入江户城后，可以任意袭击四种目标：帮助幕府的商人和诸藩浪人；妨碍赤报队行动的商人及幕府成员；出售外国商品的商人；囤积大量金银的商人。1867年11月底，赤报队在江户城里肆意横行，到处放火抢劫，整个江湖周边地区陷入骚乱。不过很快前来镇压骚乱的幕府武装发现，骚乱的浪人仿佛有个共同的大本营和避难所，那就是江户的萨摩藩邸。
幕府大名的藩邸，是有“法外治权”的，可以拒绝幕府方入内搜查，所以萨摩和赤报队才敢如此嚣张。24日，忍无可忍的庄内藩家老松平权十郎对部队下了死命令，部队前往萨摩藩邸，要求对方交出犯人，否则就强攻进去，不久庄内藩兵攻进了萨摩藩邸。庄内藩事先为防止浪人做困兽之斗，有意网开一面，只留西门不做包围，但以筱原彦十郎、儿玉雄一郎为首的五十名留守藩士，全部战死在藩邸内，无一逃跑。相乐总三和伊牟田尚平沿着江户街道，朝滨州方向狂奔，沿路还不忘四处放火焚烧民居，引起全城大混乱，使追兵失去目标。
一会儿，相乐总三一行抵达品川，在那里登上了前来接应的萨摩藩运输船“翔凤丸”，刚准备走，后面150多名跑路的浪人也来到岸边，许多人抢下渔人的小船，朝翔凤丸划去，准备搭顺风船跑路。这时幕府兵舰“回天丸”高速驶来，要翔凤丸停下接受检查，翔凤丸害怕被扣押，不等后面浪人上船，直接开走，结果最后只带走了相乐总三等28人，其余浪人全被抓了起来。
随后，西乡隆盛亲自迎接自江户逃来的相乐总三：“阁下便是维新的第一功臣！”至此，鸟羽伏见大决战正式爆发。
相乐总三和他的赤报队是明治维新中绝对的英雄，但他们的命运也是悲剧的，后面我会再单独介绍他们的故事。
22. 鸟羽伏见大决战
当江户的事件传入大阪城后，德川庆喜四周一片激愤之声，大部分幕臣要求严厉制裁公开挑衅的萨摩藩，德川庆喜虽然知道这是萨摩藩的圈套，但实在熬不住众人的请求，终于发布了“讨萨表”，想武力上京交上此表，对萨长军开战。面对来势汹汹的德川庆喜，天皇新政府召开紧急会议，最后决定明治天皇授予萨长军官军锦旗，坚决不允许德川庆喜进入京都，在鸟羽伏见狙击幕府军。
鸟羽伏见之战对于江户的德川幕府而言充满了历史轮回和宿命的意味，当年关原之战，德川家康自关东起兵，就在京畿要道美浓国的关之原，击败了对手，掌握了日本的天下。十四年后，德川家康再次起兵，在大阪城将丰臣政权灭亡，统一了日本。现在对于德川庆喜来说，完全就是颠倒了个位置，他要从大阪城出发，也要在京畿要道鸟羽伏见，击败宿命中的对手，但是历史中的巧合还远不止这些。
日下午四时，担任入京先锋队头目的大目付泷川具拳，在下鸟羽小枝桥附近遭到了萨摩藩的阻截。双方交涉无效之后，泷川命令部下发炮，这一炮宣布了决战的开始。下鸟羽方位开火后，在伏见奉行所背面御香宫神社驻扎的五百名萨摩兵，以及驻扎在东面桃山的萨摩炮兵阵地，也开始朝奉行所炮击。这样，鸟羽伏见之战全面打响，而新选组的主要战场，就是伏见。
这一战幕府军的军力为一万五千人，其中幕府直属步兵队五千人，会津藩三千人，桑名藩一千五百人，还有见回组改编的新游击队、新选组等。相对应，新政府军的主力为萨摩藩兵，总人数只有五千人，但在接下来的战斗中，幕府军落后的战术和混乱的指挥，让己方的人数优势无从发挥。在伏见方面，幕府军的军力由土方岁三的新选组、林权助的会津藩士及久保田备中守的步兵队组成，总人数800余人，其中新选组有130多人。
一开战，幕府方就处于极度不利的局面，御香宫的萨摩军炮台，能俯瞰整个伏见奉行所，如雨的炮弹很快就把奉行所阵地炸的烟雾弥漫。面对萨摩军猛烈的炮火，土方岁三决心发挥新选组白刃战的优势，要朝御香宫方向发动冲锋。入夜时分，最终十名敢死队员被选出，以永仓新八为首，其下包含岛田魁、伊东铁五郎等。永仓新八穿着浅葱色的队服，高举着太刀，带领队员翻过伏见城的土塀，朝御香宫杀来。萨摩兵也被这样的气势吓得一时惊呆了，但很快的，萨摩均派出了八十名“铳击队”排成横队向敢死队密集射击。萨摩使用的新式恩菲尔德步枪，装弹和射击速度非常快，在敢死队面前形成了恐怖的弹幕，永仓新八冲了几次，好几名队员都被射倒，其他人也被火力压得抬不起头，这时伏见街道又出现长州和土佐军放火焚烧伏见街道旁的民居。永仓新八无奈，只能下达全队撤退的命令，萨摩士兵朝着敢死队的背影跟踪射击，又有不少队员被打倒，结果永仓在翻回奉行所土塀时，因为身上的装备太重而滑下，眼看就要成为萨摩军的活靶子。这时事先翻过来的岛田魁一跃踩在土塀上，突发神力，单手就把永仓轻巧的提了过来，让战场双方斗啧啧称奇。
夜袭失败后，萨摩军继续用炮火轰击奉行所，奉行所内一片火海，不得已，土方岁三和林权助等带领部队放弃伏见，退守大阪城外的淀川。就在同一天，在下鸟羽处的幕府军也遭到了严重的打击，在此担任先锋的是原京都见回组佐佐木只三郎属下的新游击队，佐佐木只三郎搞暗杀是个好手，但完全不懂打仗，他让部下排成密密麻麻的队形，手持兵刃朝萨长军阵地杀去，结果在对方的猛烈炮火前死伤惨重。就在幕府军节节败退之时，仁和寺宫亲王亲自来到阵前，代表天皇授予萨长军锦御旗，并称天皇已经下令“有御旗的萨长军就是天皇的官军，而萨长的敌人幕府就是贼军。
天皇的御旗一出，战场的形势就发生了根本的变化，有谁愿意加入贼军作战？鸟羽街道的幕府军发生了极大的动摇和分裂，幕府军开始丧失了对抗的勇气，纷纷败退，官军随后沿着桂川南下攻击，而新选组退守的富之森，成为了官军猛攻的首要目标。
23. 富之森败退
富之森扼守着幕府本阵淀城的大门，一旦此处失守，气势如虹的官军就会长驱直入，攻陷幕府的本阵，这样德川庆喜就彻底失败了。因此土方岁三勉励队员们拼死抵御官军的进攻。可是血肉之躯哪里是火枪大炮的对手？官军先锋一面勇猛冲锋，一面朝新选组发射子弹。新选组的许多队员太刀被击断，倒在血泊当中。其中第六小队队长，新选组内最重要的副长助勤，井上源三郎腹部中弹，倒下了。
井上源三郎，是在新选组出现前，就在试卫馆跟随近藤勇的元老级人物、另外土方岁三也是由他介绍，加入天然理心流的。井上源三郎在新选组期间并没有展现出过分出色的剑术，但在高手如云的组织里，他却是个不可或缺的重要人物。因为他稳重、和善，无论是新选组里的哪门哪派，都把他当做可以信赖的人，这恐怕是任何一名队员都无法媲美的。近藤勇清除芹泽鸭后，任命井上源三郎担任组内对外接待的职务，年轻的队员也都把井上当做自己的兄长，按照八木家（新选组初期寄宿的民家）的为三郎评价，井上是个“平时从不表现自己厉害的一面，但组内却没人能有他那样的威信”的人。值得一提的是，井上和冲田总司的关系非常的好，总司称呼他为“源先生”，每次井上穿着练习服前去道场时，都会看见冲田总司和周围的一群孩子在一起玩。这是冲田就会冲着源三郎喊道：“源先生天天练习，还真是勤快热心。”井上源三郎就会苦笑着对冲田说：“怕是再热心，也比不上冲田的剑术呢。”
这时在大阪城里因为肺病，和近藤勇一起疗养的冲田总司，还不知道他所敬仰的这位源先生正在捂着鲜血横流的腹部，在地上痛苦翻滚。离他最近的是他的侄子井上泰助，“泰助，拜托了，快帮我结束......”，泰助留着泪点了点头，挥刀砍下了源三郎的首级，结束了他四十岁的生命。
富之森的新选组，在长州的进攻下全线败退，除了是去了组内最重要的干部井上源三郎外，山崎烝也中弹昏迷不醒。但更让新选组痛苦的是，淀藩藩主稻叶正邦，因为得知前线战事不顺，便暗中变节，下令紧闭城门，拒绝幕府军入内。失去了休整地点的幕府军继续败退，体力和作战意识已经降到了最低线。
1月6日，幕府军败退到了淀川附近的男山，准备做最后一搏，土方岁三率领的新选组在前去占领战略要地桥本宿场时，遭遇了官军，双方展开了激战。负责把守淀川沿岸阵地的桑名藩和对面的萨摩藩隔岸射炮，战士进入了胶着状态。就在双方相持不下时，从幕府方的津藩阵地上飞来的炮弹，决定了幕府军的败局。
津藩在关键时刻叛变了，将炮口转向了昔日的主人德川幕府，这绝对是鸟羽伏见之战中最有戏剧性的一幕。当年关原之战时，德川家康正是在关键时刻，收买了西军阵营中的小早川秀秋，秀秋的叛变最终导致了西军的失败。没想到二百多年后，这样的结局居然出现在德川家康的后代身上，可谓是报应不爽。津藩的炮击，使幕府阵地混乱一片，也对幕府军造成了致命伤害，幕府阵营全线崩溃。桥本方向的新选组，也和幕府军一起撤退，永仓新八、斋藤一等20名队员分成几组，担任了殿后的艰巨任务。最后在桥本堤岸下的几条小船，才让土方的队伍逃出生天，回到了大阪。
桥本之战宣告了持续四天的鸟羽伏见大决战，以幕府方的彻底失败告终。此战新政府新政府战死110多人，幕府军战死280多人，其中新选组战死逃亡15人。另外，原京都见回组的头目佐佐木只三郎，也在桥本战场上中弹受了重伤，不久后死去。鸟羽伏见之战决定了幕府的灭亡。幕府在第二次长州征伐后，还能维系勉强的惨淡经营，但经过此战，完全是威信扫地，幕府的末日来临了。
24. 庆喜的败逃
1月6日晚，德川庆喜在大阪城接见了自己的军队，他模仿西方的将军，在士兵前慷慨陈词，发誓要以大阪为根据地重整旗鼓，寻找时机重新杀回京都。但是当其他人还在保有一丝希望的时候，庆喜却和老中板井胜静、会津藩主松平容保等人彻夜商议，最终做出了放弃大部队，乘船从大阪返回关东的决定。因为德川庆喜认为，鸟羽伏见大败，多米诺骨牌的效应已经开始显现，整个京畿和西国的大名开始动摇了，津藩的叛变就是最好的例子。如果再留在大阪城，德川庆喜很可能遭到各方叛变势力的包围，那时想走可就难了，何况回到关东还有忠于他的八万旗本，完全可以东山再起。
就这样，1月8日庆喜一干人秘密登上了停泊在大阪湾的幕府军舰“开阳丸”，启程返回江户。同日，土方岁三，将新选组分为两拨，永仓新八率领无伤无病的队员，为第一队，乘坐“顺动丸”离去。而土方、近藤和伤员为第二队，乘坐“富士山丸”取道兵库港回江户。将军擅自离开的消息很快传遍大阪的各个军营，绝大多数士兵对此又惊讶又失望，这时已经没有什么人愿意为江户政权殉葬了，所有部队返回了他们各自所在的藩国。1月9日，长州军在没有任何抵抗的情况下，接管了大阪城，天下的形势发生了根本性变化。
当富士山丸开到纪州海峡时，新选组在富之森战场上受重伤的山崎烝，突然因为伤口感染，发起了高烧。近藤和土方已经能行走的队员，全部围在山崎的病榻前，希望山崎能度过此劫。无奈天不佑人，山崎烝最终还是离开了人世。
山崎烝在新选组里，是和井上源三郎一样温和尽责的人，一向有着极好的人缘。他和岛田魁一起，长期担任新选组的诸士调役监察职务，意思就是最危险的火线侦察任务，池田屋事件前，就是他和岛田魁联手，突入了古高俊太郎的伪装店铺，破获了长州尊攘派的计划。新选组突袭池田屋前，也是山崎烝冒着生命危险，只身潜入池田屋附近，为近藤勇调查到了第一手的战场局势，为作战成功做出了巨大的贡献。但山崎烝事后却一点不争功，下赐赏金时却没有他的名字。之后的蛤御门之变，第二次长州征伐，也是山崎烝，游走在各地，替近藤勇提供了第一手的详细情报，其准确性和及时性得到了近藤勇的高度肯定。而且山崎烝还一直学习医术，为的是能够在需要时，做新选组的专用医生。
现在这个温和、认真而值得信赖的人死去了，实在让队员压抑不住心中的悲哀。左肩受伤的近藤勇，坚持自己穿上正装，来送别战友一程。而土方岁三找到了舰长榎本武扬（幕府的海军将领，后来的虾夷共和国总统），跪在了他的面前，流着泪说：“山崎君是个好人，现在我们新选组却永远失去了他，希望舰上所有人都能参加他的葬礼，这样的话他也会高兴的。”榎本武扬深受感动，便带着全舰水手参加了山崎烝的葬礼。新选组为山崎举行的是水葬，伴随着所有水手的脱帽礼，送行的军舰枪炮声，山崎烝的灵柩被缓缓的吊入海水中，随后慢慢的向天际方向飘去。
25. 冲田总司的执着
日，富士山丸在横滨鸣笛抛锚，近藤勇和土方岁三下令，将伤病员送到横滨当地的西洋医院接受治疗。次日，为表彰新选组在鸟羽伏见之战中的忠勇，幕府和会津藩拨出2300两赏金用于休整。登城之后，近藤勇带着幕府的赏金，立即去了松本良顺大夫的医学所，支付给他一百两酬金，请求立即将横滨医院的伤员转移到松本的医学所来。
这时松本留意到了近藤勇身边的冲田总司，说道：“总司，上次我去京都时，就确诊你为......”不等他说完，冲田总司立刻笑着打断了松本：“是啊，是轻微的中暑症状，冲进池田屋时的天气实在是太热了，像我这样单薄的，一下子就晕倒了，哈哈。”松本大夫看着冲田蜡黄的脸，便摇了摇头不再说下去了。等到近藤和冲田离开时，松本良顺把医疗记录拿了出来。这是当时他去西本愿寺为新选组队员体检时留下的，当他翻到冲田总司那页时，上面写着“冲田总司，确诊罹患肺结核”，一行小字分外的醒目。
冲田总司自小父母双亡，九岁时就进入了试卫馆道场，总司的剑术天赋极高，甚至连近藤勇和土方岁三都自叹不如，年纪轻轻就成为了天然理心流的塾头，负责教授入门弟子剑术。冲田总司的剑术秘技叫“平正眼”（叫法可能不一，但都相似）：前足悄无声息的跨出，把剑平刺出，然后急速再把剑收回再刺出，能在迅雷不及掩耳之势下连续刺出三下，让对方无法招架。冲田总司是公认的新选组第一剑士，永仓新八也在他的《新选组颠末记》中写到“土方岁三、井上源三郎、藤堂平助、山南敬助拿竹剑（和冲田比试的话）简直是被当孩子一般来耍，大家都说这家伙要是动真格起来恐怕连师傅近藤勇都要败在其剑下”可见冲田总司剑术之高，因此冲田总司在当时被誉为“幕末天剑”。不过冲田总司最吸引的人的，恐怕要算他的性格，有人在1960年时采访过小时候和总司玩过的老婆婆（绝对高寿，当时是小女孩儿），她说冲田总司性情非常的温和，是个喜欢说说笑笑，和孩子们厮混在一起的大男孩儿。即使是临敌时也能谈笑自如，但一旦进入到战斗中，总司就会全力以赴斩杀敌人。令人惋惜的是，就是这样的一个可爱大男孩，他的生命已经时日无多了。
就在前一年，大政奉还之前，长州藩的英雄高杉晋作，就因为肺结核而英年早逝，没能见到他梦想中的新日本，在这个时代，肺结核就是绝症的代名词，也许冲田最后的梦想，就是拿着剑战斗到生命的最后一刻吧。
26. 甲阳镇抚队出阵
时局一日日紧张起来，新政府神速的开始组建东征大军，目的是为了消灭德川幕府。到一月底，京畿、西国、东山、东海等地基本都背叛了幕府，转而投靠新政府，德川庆喜的形势一泻千里。随后新政府的东征大军直接朝着幕府的老巢江户杀来，在这个关头，德川庆喜丧失了抵抗的勇气，居然跑到上野的宽永寺幽居去了。眼见将军如此，近藤勇等人十分着急，便只身回到江户城，找到了幕臣胜海舟（胜麟太郎）商量应对之法。胜海舟是幕府里的开国派，也是坂本龙马的老师，胜海舟建议新选组可以先行一步，进军关东的屏障甲斐，占领要地，迎击新政府军，他再说服将军动员大军，随后给予近藤勇支持。
近藤勇大喜，组建了名为“甲阳镇抚队”的新武装（其实还是新选组的骨干部队），准备开赴甲斐，轰轰烈烈的大干一场。近藤勇还让土方岁三用会津藩下赐的赏金购买了两门大炮，加上幕府给予的五百挺铁炮，作为镇抚队的武器。接下来，近藤勇改名为大久保刚，土方岁三改名为内藤隼人，率领着156名甲阳镇抚队，于3月1日自江户出发，浩浩荡荡的朝甲斐赶去。大久保和内藤都是德川谱代家臣的苗字，近藤和土方改用这些苗字，一来是为了表示对幕府的中心，二来也是渴望成为新的谱代武士的虚荣心在作祟。出发前，土方岁三一身洋装，剪断了发髻，骑着一匹白马，威风凛凛。整个镇抚队也不再像之前新选组那样，穿着浅葱色的羽织，而是统一穿着白棉洋装，扛着清一水的步枪，俨然是只洋式部队。
就在3月2日晚，镇抚队在土方的姐夫佐藤彦五郎家借宿的时候，冲田总司倒下了，整个身体蜷缩在一起，并伴随着撕心裂肺的咳嗽。虽然早就知道总司肺部有病，但近藤实在没想到会到今日的程度。冲田像个孩子一样流下泪来，土方按住了冲天的肩膀安慰他：“总司，回江户去，到松本大夫那儿把病治好，你永远都是新选组第一小队的队长。”
望着土方，冲田像孩子般笑起来：“那就这么说好了，就算是土方也不能反悔。”冲田总司因为肺病恶化，在甲阳镇抚队到达战场前，不得已离队，回到江户接受治疗，这使得冲田总司直到生命的最后，也没有作为军队的一员参加一场战斗，不能不说是个遗憾。
其后，近藤勇率领的甲阳镇抚队，开始越过甲斐与武藏交界的险峻山地，当日整个关东风雪交加，山路崎岖难行，但是更要命的是，镇抚队从江户带来的两门大炮成了全队上下的噩梦，每门炮都被队员拆成三部分，每部分都需要两匹马才能拉得动。出于作战的重要性，近藤勇还是舍不得放弃这两门炮，带着人硬是把炮扛了过去。结果到了五日，不好的消息传来，甲斐国的首府甲府城，早在三日前就已经被新政府军占领，政府军人数达到1400人。这时近藤勇还抱着一丝希望，认为只要镇抚队打得英勇，就会振奋幕府的士气，然后幕府的援军就会源源不断，时局总会扭转的。
但镇抚队这些人可不愿意陪着近藤勇发疯，许多人趁夜逃走。等到3月6日的时候，甲阳镇抚队从开始的300人，只剩到120人左右。近藤勇也觉得单靠这些人阻挡官军，是不可能的任务，便让土方岁三骑马急速赶赴神奈川，请求援兵。土方走后，近藤勇率领镇抚队登上了能控制甲州街道的胜沼柏尾山东侧，在这里，镇抚队遭到官军和土佐迅击队的围攻。眼见官军从四面八方冲击过来，近藤勇急忙命令用大炮轰击，谁知千辛万苦运来的这两门大炮，全部都发不出来，成了不折不扣的哑巴炮。官军的大炮不断轰击，镇抚队彻底丧失了斗志，纷纷逃窜。开战仅两个小时，甲阳镇抚队全部溃散。退往八王子的近藤勇，见到了求援回来的土方岁三 ，他见到了幕府旗本的武装“菜叶队”，但任由土方如何哀求，菜叶队始终不肯进行援助。近藤勇长叹一声，难道江户幕府二百六十年的基业，真的要葬送在这里了？
日，逃回到江户城的近藤，又将面临一个难堪的事实，这天永仓新八和原田左之助找到了他，再次要求脱队。这次，一败再败的近藤勇，再也没有实际权威阻止永仓和原田的要求了。永仓和原田离去后，和神道无念流的同门芳贺宜道，收拢了一批幕府的脱藩浪人和旗本，组建了100余人的“精兵队”，由芳贺宜道任总长，永仓和原田任副长，精兵队随后活跃在于新政府军作战的“上野战争”中。鸟羽伏见的战败，镇抚队的惨败，加上此时的内部大分裂，显赫一时的新选组实际已经走向了历史的末路。
27. 江户开城、幕府投降
原来胜海舟把近藤勇支出去搞甲阳镇抚队，完全是个阴谋。就在主战派的近藤勇滞留前线时，胜海舟一帮人，连带德川庆喜，早已和天皇新政府私下秘密联络，准备江户开城，投降新政府了。目的是为了保存德川一脉。
而面对如何处置江户幕府，新政府内部也分为强硬派和宽大派。强硬派以西乡隆盛为首，强调一定要让德川庆喜切腹谢罪才可以。但长州的桂小五郎和广泽真臣则认为，若真把德川庆喜逼急了的话，这场内战便会旷日持久下去，列强一定会趁机介入日本的内政，因此天皇新政府更倾向于宽大处理江户幕府。
3月5日，征东大军已经抵达日本的骏府城，总参谋西乡隆盛决心，次日便发动对江户城的总攻击。就在这千钧一发的时刻，有三个重要人物，改变了江户城陷入惨烈战火的命运。他们分别是第十三代将军德川家定的正室，天障院笃姬；嫁给第十四代将军德川家茂的，孝明天皇的妹妹静宽院宫；还有和幕府交好的轮王寺宫公现法亲王。在这三个人的不懈努力和斡旋下，西乡隆盛不得不放弃坚持，最后连英国公使也害怕江户发生战端，会让横滨遭受牵连，开始向西乡隆盛施压。
3月24日，幕府再次派出陆军总裁胜海舟为谈判使节，与西乡隆盛展开了交涉，并且双方完成了议和条件的雏形。新政府对德川庆喜的处置为“减免死罪，即刻回水户接受谨慎处分。”同日，江户城没有对征东军作出任何抵抗，无血开城。德川家由幕府降格为骏河70万石的普通诸侯，失去了对国家的掌控能力，日本的天下重新归于天皇手中。但德川庆喜的降伏，并不代表日本内战就此结束，恰好就是议和书上的一些条款，导致了一些藩国对新政府的不满和抗争，战争还会持续下去，天皇新政府要走的路还很长。
28. 近藤勇的投降与死
1868年4月，听闻江户城投降的近藤勇，只得将大本营转移到了下总的流山（今千叶县流山市）。这时，东山道总督府大军监香川敬三，领大军朝下野宇都宫藩进发，顺便将近藤勇所在的流山团团包围，近藤勇此时身边只有十多名旧新选组骨干，根本没有于官军一战的资本。结果让新选组队员惊讶的事情来了，近藤勇居然也要步德川庆喜的后尘，出去投降官军。
土方岁三第一次和近藤勇发生了激烈的争吵，土方认为虽然德川庆喜投降了，但新选组投靠的会津藩，因为被新政府定为“朝敌”身份，还不愿意投降，正在和其他对新政府不满的藩国联盟，准备对抗新政府。这时，新选组所做的不应该是向官军投降，而是杀出重围，前往参见松平容保，和会津藩一起共进退。但近藤勇却已经失去了继续抗争下去的勇气，声称要为自己的部下负责，不能让他们全死在这里。土方见近藤一意孤行，非常气愤，在流山和近藤分道扬镳，与相马主计一起前往江户城潜伏起来。
4月3日，近藤勇与野村利三郎、村上三郎一起，前往东海道总督府大营，表示投降。不过，当时近藤勇还是没能坦荡的说出自己的身份，声称自己是名叫大久保刚的幕臣。不巧的是，近藤勇的死敌，原御陵卫士组队员加纳鹫雄恰好就在总督府军中，他一眼就认出了近藤勇。就在近藤勇还在辩解的时候，加纳带领几名士兵走到近藤的面前，扯下了他的衣服，只见近藤的左肩上，一个铁炮铅丸形成的伤口赫然在目。这时的近藤勇已经无从狡辩，并且不再言语，沉默的望着远方。
接下来，围绕着如何处置这名大名鼎鼎的新选组局长，官军内部也发生了激烈的争吵，萨摩方主张将近藤勇移交到京都，由新政府对他进行处罚；而与新选组积怨很深的萨摩方则认为，应该对近藤勇处以斩立决。
4月25日，正当土方岁三和会津藩并肩和官军在宇都宫、白河关激战时，前新选组局长近藤勇在板桥宿刑场（现东京板桥区泷野川附近）被斩首，享年35岁。
近藤勇的投降，虽然为他的人生抹上了不光彩的一笔，但纵观近藤勇一生，他从卑下的多摩川农民出身，靠着自己的权谋和打拼，先是继承了天然理心流，后又成为幕府最强人斩集团新选组的头号人物，最终实现了成为幕臣武士的梦想，怎么也能算是个草莽英杰了。
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第六部：戊辰战争
江户城的无血开城，标志着德川幕府彻底退出了历史舞台，但是日本的内战还远没有结束。由于会津藩主松平容保被认定为“朝敌”，一些东北诸藩也因不满新政府中的西南雄藩专政，以会津藩为首的临时奥羽同盟成立了，继续与新政府抗争着，宇都宫、上野和白河关之战统称为“戊辰战争”。而近藤勇的死，并不代表新选组已经消失，还有一个人将会继续顶着新选组的名号作战到最后一刻。
29. 鬼副长的奋起--- 一战宇都宫
甲阳镇抚队失败了，永仓新八离去了，冲田总司病倒了，近藤勇投降后被斩首了，江户幕府也灭亡了，这时在世人眼中曾叱咤风云的新选组已经名存实亡。但却还有一个人继续拿着刀剑，举着新选组的诚字旗与新政府对抗着，从下野一直作战到北海道，为旧时代流干了最后一滴血。这个人就是新选组的“鬼副长”土方岁三，他在接下来的岁月里，完美的诠释了“新选组还没有结束，我土方岁三就是新选组”的铮铮誓言。
因为记恨八一八政变被驱逐的耻辱，京都公卿三条实美，要求可以放过德川庆喜，但绝不可以放过会津藩主松平容保、和桑名藩主松平定敬这兄弟俩。最后松平容保和会津藩被认定为“朝敌”。于是愤激的松平容保和会津藩士，决心要以日本东北为基地，和征东官军死战到底。
听闻会津藩起兵反抗新政府后，土方岁三带着岛田魁、中岛登、田山芳次郎等剩下的同志，往会锦方向走去。但在土方途经下野宇都宫时，遇上了大批旧幕府军正在对峙官军先锋香川敬三。因为德川庆喜投降后，原先的八百万石天领，一下子缩水成了70万石，数万幕府旗本被裁员，失去了生活来源，这些旧幕府军便决心继续抗争，要和新政府杀个你死我活。
日，2200名旧幕府军集结在下总的国府台，准备发动对宇都宫城的强袭战。强袭部队以旧幕臣大鸟圭介为军总监，以新选组副长土方岁三为军参谋、阵容成员有幕府步兵队第七连队、旧桑名藩军、幕府传习队、回天队、新选组。其中原先与近藤勇分离跑去参加“精兵队”的永仓新八和原田左之助，此时也率部来参战。队伍集结完毕后，土方建议大鸟圭介为兵马总指挥，并将人马分为前、中、后三军。分队完毕后，土方将攻击宇都宫的人马分成两部，前军为别动队，归土方指挥，中军后军即后援队为本队，兵分两路夹击宇都宫。
首先与新政府军交手的，是大鸟圭介的本队人马，4月16日在小山与自宇都宫南下的香川敬三的部队遭遇，发生了激战（小山之战）。大鸟圭介的法国式传习队枪炮打的如泼水般，而香川敬三的部队大多是原本忠于幕府的彦根藩兵，本来斗志就不高，结果没几个回合就败下阵来。大鸟本队的胜利，极大的鼓舞了东北诸藩的士气，而土方的别动队，经过几天的急行军，已经在4月19日出现在宇都宫城下的街道上。此时，防守宇都宫的新政府军，只有600人，由香川敬三、户田忠恕、平川和太郎联合指挥，分散聚首在几个村庄中。
4月19日清晨，别动队集结在宇都宫城下满福寺前，土方亲自挥刀，斩下了三名来自黑羽藩奸细的首级，祭祀了军神。别动队士气空前高涨，朝宇都宫城发起了总攻。先是两百名桑名藩兵担任先锋，强攻了把守砂田村的彦根藩小队，彦根藩刚从小山败下来，士气十分消沉，根本扛不住桑名藩兵凶狠的攻势，没多久，砂田村落入了土方手中。随后，土方岁三急忙命令精锐的传习队第一大队，从砂田村绕到了濑村和平松村的背后，散开队形用枪炮猛轰官军阵地。宇都宫藩兵虽然勇敢抵抗，但是由于武器老旧，又刚刚镇压了藩内的农民暴 动，十分疲累，根本不是传习队的对手，在死伤了不少人后也放弃了阵地，朝宇都宫城跑去。土方别动队不费丝毫力气的来到了宇都宫城下，开始攻城。土方命令传习队和回天队，攻击城的东北侧，新选组和桑名藩兵攻击城的东南侧。其中在新选组负责攻打的下河原门的战斗最为惨烈，土方岁三身着洋装，披散着头发挥刀，带着少数队员冲在第一线，打起了残酷的白刃战。
这时，一名旧幕府士兵被战斗吓得脚软，回身准备逃跑，不想被土方看见。土方一个箭步上去砍下了这名逃兵的首级，随后大喊：“谁敢临阵脱逃，这就是榜样！”部下一见，个个是又敬又怕，舍命往前冲锋，一下子就打垮了城门的守军。战斗进行到下午二时，幕府传习队攻占了宇都宫外的制高点二荒山神社，在上面架起了最新式山炮，炮轰宇都宫城，眼见守城无望的官军纷纷撤离。这样，关东下野的重镇宇都宫城落入了旧幕府军的手中。
30. 二战宇都宫
得知己方在宇都宫战败的消息，新政府军震惊不已，他们没有想到江户开城不过是战争泥沼的开始而已。于是，新政府军火速派遣援军，最早进发的河田景与队，火速占领了宇都宫前方的壬生城，并封锁了宇都宫和壬生城之间的要道安冢。
4月23日，550名官军从壬生城出发，兵分三路对宇都宫城发动攻击，官军先用火炮轰散了把守泷尾神社的旧幕府军，然后又击溃了六道口、新町方面的旧幕府守军，但在接下来攻打宇都宫城西之丸的时候，遭到精锐传习队的反击，被打死打伤30多人，萨摩藩队长井上猪右卫门阵亡。
智将大鸟圭介又派出了小分队迂回到官军后方，焚烧夺取官军的粮草辎重，让官军陷入了苦战。下午三时，新政府的官军出现在了宇都宫城的南侧，与把守松峰门的新选组发生了激斗，土方岁三又一次站在火线上鼓舞士气，不过这次他的运气不好，被流弹击中了左腿，只得脱离了战线。官军的攻城部队越来越多，并用压倒性的火力轰击宇都宫城和二荒山神社，旧幕府军渐渐支持不住，只能放弃了宇都宫城，撤到了圣地日光山，准备和官军做最后的死战。
在这时，日光东照宫的僧侣害怕双方一打仗，炮弹会把这座古刹毁于一旦。于是找到官军司令板垣退助，请他不要让古寺遭受兵火的摧残，于是板垣派遣使者和旧幕府军做出了个君子协定，旧幕府军撤下日光山，新政府军绝不做任何追击。就这样，新政府军成功收复了宇都宫城。在接下来的会津战争中，宇都宫成为了新政府军最稳固可靠的桥头堡，为战争的胜利做出了卓越的贡献
31. 原田左之助之死
就在土方岁三和永仓新八加入旧幕府军，前往攻打宇都宫城时，却有一名新选组重要干部中途脱队，跑去关东的上野，投身到属于自己的战场，这个人便是新选组第十小队的队长---原田左之助。
原田本来和永仓新八在甲阳镇抚队解散后，离开了近藤勇，和芳贺道宜组建了“精兵队”。后来这两人在近藤勇被俘后，又顾念起新选组的战友情谊，来到下总国府台，参加了旧幕府军的后援队。但就在旧幕府军出发之际，原田左之助突然不辞而别，至于原田离开的原因，迄今没有详细的资料可以说明。不过我们可以肯定的是，原田左之助离开后援队绝不是因为贪生怕死，而是他认为上野才是最合适自己的战场。或者说直接点，原田根本不喜欢接受大鸟圭介和土方的节制，他是个像风一样追寻自由的猛士，希望在战场上无拘无束畅快的作战，然后孤独而壮烈的死去。
与新选组其余精通剑术的队员不同，原田的流派是宝藏院枪术流下的分支种田流，所以最擅长使长枪。油小路之战时，正是原田左之助在关键时刻刺翻了卫士组二刀流的高手服部武雄，为新选组的胜利立下奇功。另外，原田的剑术也有着极高的造诣，丝毫不比冲田、斋藤这些使剑高手弱。所以身兼各种武艺的原田，在组内和冲田总司一样，都是深受近藤勇信赖的杀手，但原田身上最大的特点，就是粗暴好杀，外加桀骜不驯。原田年轻时是伊予松山藩一名武士的仆人。有一次他的一个同事嘲笑原田并非武士出身，一定连切腹的礼节都不知道。结果惹得原田兴起，当即抽出短刀，扯开衣服，来了个现场切腹，把那同事和在场的人吓得魂不附体。切完之后，原田还向他的那个同事轻蔑的笑了一下，然后咕咚一声倒地不起。
不管如何，切完腹的原田还是活了下来，那个切腹的“一文字”伤口也结成了伤疤，成为原田最骄傲的勋章，不管多冷的天都敞着怀，把这个勋章展示给别人看。到了后来，无论是在试卫馆当食客，还是在新选组当副长助勤，原田的火爆脾气一点没改。似乎也就是因为这种性格，他才和永仓新八这个和自己性格相似的人，结成了好兄弟。
让人惊讶的是，原田左之助居然是个极度疼爱自己妻子的美男子，这在养妾成风的新选组里非常罕见了。原田不仅把妻子接过来与自己同住，而且平日在外面和队员喝酒时，绝不拈花惹草，是位典型的模范丈夫。在鸟羽伏见之战之前，原田将妻子喊到自己身边，交给她两百两银子，这些银子都是原田出生入死换来的赏金。“好好带大我们的孩子阿茂，拜托了！”说完这些，原田只带上了那支与自己生死相随的长枪，头也不回的上了战场。说不定，原田左之助之所以跑去上野参战，就是希望能离曾经在京都的家近一些吧，尽管没有人知道真正的原因。
原田左之助去了上野后，就参加了由旧幕臣组织起来的“彰义队”。鸟羽伏见之后，一批旧的幕臣成立了“以保护德川庆喜”为职责的彰义队。江户无血开城后，彰义队离开了江户，并拒绝承认新政府，后来他们还拥戴了轮王寺宫公现法亲王，喊着要复兴德川幕府。若单纯是旧幕臣闹事，新政府还能拿出耐心来说服教育下，但这彰义队居然还抬出了一位亲王，这可是明摆着要在日本搞两个天皇。所以新政府内部一致同意，彻底剿灭彰义队（上野战争）。
征剿彰义队的官军总指挥，是在第二次长州征伐中表现出色的长州藩士大村益次郎，是位被评为“有鬼神之机”的悍将。而且大村属下装备的都是清一水的新式后装式步枪，还配备了大批山炮。而彰义队虽然有3000余人，但大部分人的武器是长枪太刀，只有少数人拥有火器，还是落后的前装式施条步枪。
5月15日，萨摩藩的精锐铳击队开始攻击位于黑门的彰义队阵地，战斗打响。为支援黑门阵地，山王台的彰义队大炮开始压制官军，但没想到的是，位于高地的彰义队火炮性能落后，根本打不到黑门，而萨摩、熊本藩的大炮性能优越，虽然处在低地，射程却能覆盖整个黑门和山王台地区，战斗呈现了一边倒的局面。山王台上的彰义队头目天野八郎见黑门战况危急，戴上了四十多名旧幕府旗本，准备支援黑门阵地，但还没跑到黑门，除天野八郎外的其他人就都在半路逃走了。无奈之下，天野八郎也只能临阵脱逃，后被官军抓住，死在了监狱里。
官军势如破竹，先是攻破了黑门，后又攻陷了天王寺。此时，以原田左之助这样的浪人和下层}