求根据dna找家族族

点击联系发帖人 时间：2015-04-03 12:25
找一下家族史

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古墓辽代女尸专家通过DNA检测，和耶律家族有关

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Blast进行同源基因的寻找

基于蛋白的仳对结果寻找某一个蛋白家族的同源基因，使用如下的参数

首先对感兴趣的基因家族蛋白序列建立索引

然后使用blastp比对到建立好索引的数據库

NCB blast-2.8版本可支持用NCBI自带代码分割的NR子库的索引作为比对的库使用比较方便

如果只想比对到单一物种人9606

比对NR子库哺乳动物的话，需要先建個哺乳动物子库tax_id索引

将序列比对至NR哺乳动物子库

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